Protein–RNA interactions for Protein: P57780

Actn4, Alpha-actinin-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn4P57780 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Actn4P57780 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Actn4P57780 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Actn4P57780 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Actn4P57780 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Actn4P57780 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Actn4P57780 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Actn4P57780 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Actn4P57780 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Actn4P57780 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Actn4P57780 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Actn4P57780 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Actn4P57780 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Actn4P57780 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Actn4P57780 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Actn4P57780 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Actn4P57780 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Actn4P57780 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Actn4P57780 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Actn4P57780 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Actn4P57780 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Actn4P57780 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Actn4P57780 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Actn4P57780 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Actn4P57780 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Actn4P57780 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Actn4P57780 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Actn4P57780 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Actn4P57780 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Actn4P57780 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Actn4P57780 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Actn4P57780 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Actn4P57780 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Actn4P57780 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Actn4P57780 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Actn4P57780 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Actn4P57780 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Actn4P57780 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Actn4P57780 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Actn4P57780 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Actn4P57780 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Actn4P57780 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Actn4P57780 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Actn4P57780 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Actn4P57780 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Actn4P57780 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Actn4P57780 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Actn4P57780 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Actn4P57780 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Actn4P57780 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Actn4P57780 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Actn4P57780 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Actn4P57780 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Actn4P57780 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Actn4P57780 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Actn4P57780 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Actn4P57780 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Actn4P57780 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Actn4P57780 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Actn4P57780 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Actn4P57780 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Actn4P57780 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Actn4P57780 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Actn4P57780 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Actn4P57780 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Actn4P57780 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Actn4P57780 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Actn4P57780 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Actn4P57780 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Actn4P57780 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Actn4P57780 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Actn4P57780 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Actn4P57780 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Actn4P57780 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Actn4P57780 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Actn4P57780 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Actn4P57780 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Actn4P57780 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Actn4P57780 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Actn4P57780 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Actn4P57780 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Actn4P57780 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Actn4P57780 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Actn4P57780 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Actn4P57780 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Actn4P57780 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Actn4P57780 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Actn4P57780 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Actn4P57780 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Actn4P57780 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Actn4P57780 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Actn4P57780 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Actn4P57780 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Actn4P57780 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Actn4P57780 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Actn4P57780 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Actn4P57780 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Actn4P57780 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Actn4P57780 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Actn4P57780 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms