Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gsc2P56916 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gsc2P56916 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gsc2P56916 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gsc2P56916 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gsc2P56916 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gsc2P56916 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gsc2P56916 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gsc2P56916 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gsc2P56916 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gsc2P56916 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gsc2P56916 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gsc2P56916 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gsc2P56916 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gsc2P56916 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gsc2P56916 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gsc2P56916 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gsc2P56916 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gsc2P56916 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gsc2P56916 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gsc2P56916 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gsc2P56916 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gsc2P56916 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gsc2P56916 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gsc2P56916 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gsc2P56916 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gsc2P56916 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gsc2P56916 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gsc2P56916 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gsc2P56916 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gsc2P56916 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gsc2P56916 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gsc2P56916 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gsc2P56916 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gsc2P56916 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gsc2P56916 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gsc2P56916 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gsc2P56916 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gsc2P56916 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gsc2P56916 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gsc2P56916 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gsc2P56916 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gsc2P56916 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gsc2P56916 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gsc2P56916 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gsc2P56916 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gsc2P56916 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gsc2P56916 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gsc2P56916 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gsc2P56916 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gsc2P56916 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gsc2P56916 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gsc2P56916 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gsc2P56916 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gsc2P56916 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gsc2P56916 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gsc2P56916 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gsc2P56916 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gsc2P56916 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gsc2P56916 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gsc2P56916 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gsc2P56916 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gsc2P56916 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gsc2P56916 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gsc2P56916 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gsc2P56916 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gsc2P56916 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gsc2P56916 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gsc2P56916 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gsc2P56916 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gsc2P56916 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gsc2P56916 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gsc2P56916 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gsc2P56916 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gsc2P56916 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gsc2P56916 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gsc2P56916 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gsc2P56916 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gsc2P56916 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gsc2P56916 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gsc2P56916 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gsc2P56916 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gsc2P56916 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gsc2P56916 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gsc2P56916 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gsc2P56916 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gsc2P56916 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gsc2P56916 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gsc2P56916 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gsc2P56916 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gsc2P56916 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gsc2P56916 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gsc2P56916 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gsc2P56916 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gsc2P56916 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gsc2P56916 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gsc2P56916 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gsc2P56916 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gsc2P56916 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gsc2P56916 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76 ms