Protein–RNA interactions for Protein: P54276

Msh6, DNA mismatch repair protein Msh6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msh6P54276 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Msh6P54276 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Msh6P54276 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Msh6P54276 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Msh6P54276 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Msh6P54276 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Msh6P54276 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Msh6P54276 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Msh6P54276 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Msh6P54276 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Msh6P54276 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Msh6P54276 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Msh6P54276 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Msh6P54276 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Msh6P54276 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Msh6P54276 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Msh6P54276 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Msh6P54276 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Msh6P54276 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Msh6P54276 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Msh6P54276 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Msh6P54276 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Msh6P54276 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Msh6P54276 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Msh6P54276 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Msh6P54276 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Msh6P54276 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Msh6P54276 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Msh6P54276 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Msh6P54276 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Msh6P54276 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Msh6P54276 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Msh6P54276 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Msh6P54276 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Msh6P54276 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Msh6P54276 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Msh6P54276 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Msh6P54276 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Msh6P54276 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Msh6P54276 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Msh6P54276 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Msh6P54276 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Msh6P54276 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Msh6P54276 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Msh6P54276 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Msh6P54276 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Msh6P54276 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Msh6P54276 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Msh6P54276 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Msh6P54276 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Msh6P54276 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Msh6P54276 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Msh6P54276 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Msh6P54276 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Msh6P54276 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Msh6P54276 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Msh6P54276 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Msh6P54276 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Msh6P54276 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Msh6P54276 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Msh6P54276 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Msh6P54276 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Msh6P54276 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Msh6P54276 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Msh6P54276 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Msh6P54276 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Msh6P54276 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Msh6P54276 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Msh6P54276 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Msh6P54276 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Msh6P54276 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Msh6P54276 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Msh6P54276 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Msh6P54276 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Msh6P54276 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Msh6P54276 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Msh6P54276 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Msh6P54276 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Msh6P54276 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Msh6P54276 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Msh6P54276 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Msh6P54276 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Msh6P54276 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Msh6P54276 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Msh6P54276 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Msh6P54276 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Msh6P54276 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Msh6P54276 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Msh6P54276 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Msh6P54276 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Msh6P54276 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Msh6P54276 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Msh6P54276 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Msh6P54276 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Msh6P54276 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Msh6P54276 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Msh6P54276 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Msh6P54276 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Msh6P54276 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Msh6P54276 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms