Protein–RNA interactions for Protein: P51675

Ccr1, C-C chemokine receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr1P51675 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccr1P51675 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccr1P51675 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccr1P51675 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccr1P51675 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccr1P51675 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccr1P51675 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccr1P51675 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccr1P51675 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccr1P51675 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccr1P51675 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccr1P51675 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccr1P51675 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccr1P51675 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccr1P51675 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccr1P51675 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccr1P51675 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccr1P51675 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccr1P51675 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccr1P51675 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccr1P51675 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccr1P51675 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccr1P51675 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccr1P51675 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccr1P51675 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccr1P51675 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccr1P51675 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccr1P51675 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccr1P51675 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccr1P51675 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccr1P51675 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccr1P51675 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccr1P51675 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccr1P51675 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccr1P51675 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccr1P51675 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccr1P51675 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccr1P51675 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccr1P51675 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccr1P51675 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccr1P51675 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccr1P51675 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccr1P51675 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccr1P51675 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccr1P51675 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccr1P51675 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccr1P51675 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccr1P51675 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccr1P51675 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccr1P51675 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccr1P51675 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccr1P51675 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccr1P51675 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccr1P51675 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccr1P51675 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccr1P51675 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccr1P51675 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccr1P51675 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccr1P51675 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccr1P51675 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccr1P51675 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccr1P51675 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccr1P51675 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccr1P51675 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccr1P51675 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccr1P51675 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccr1P51675 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccr1P51675 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccr1P51675 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccr1P51675 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccr1P51675 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccr1P51675 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccr1P51675 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccr1P51675 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccr1P51675 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccr1P51675 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccr1P51675 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccr1P51675 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccr1P51675 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccr1P51675 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccr1P51675 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccr1P51675 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccr1P51675 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccr1P51675 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccr1P51675 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccr1P51675 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccr1P51675 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccr1P51675 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccr1P51675 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccr1P51675 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccr1P51675 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccr1P51675 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccr1P51675 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccr1P51675 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccr1P51675 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccr1P51675 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccr1P51675 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccr1P51675 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccr1P51675 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccr1P51675 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.4 ms