Protein–RNA interactions for Protein: P51612

Xpc, DNA repair protein complementing XP-C cells homolog, mousemouse

Predictions only

Length 930 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XpcP51612 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
XpcP51612 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
XpcP51612 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
XpcP51612 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
XpcP51612 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
XpcP51612 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
XpcP51612 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
XpcP51612 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
XpcP51612 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
XpcP51612 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
XpcP51612 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
XpcP51612 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
XpcP51612 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
XpcP51612 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
XpcP51612 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
XpcP51612 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
XpcP51612 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
XpcP51612 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
XpcP51612 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
XpcP51612 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
XpcP51612 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
XpcP51612 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
XpcP51612 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
XpcP51612 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
XpcP51612 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
XpcP51612 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
XpcP51612 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
XpcP51612 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
XpcP51612 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
XpcP51612 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
XpcP51612 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
XpcP51612 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
XpcP51612 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
XpcP51612 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
XpcP51612 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
XpcP51612 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
XpcP51612 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
XpcP51612 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
XpcP51612 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
XpcP51612 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
XpcP51612 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
XpcP51612 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
XpcP51612 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
XpcP51612 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
XpcP51612 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
XpcP51612 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
XpcP51612 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
XpcP51612 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
XpcP51612 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
XpcP51612 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
XpcP51612 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
XpcP51612 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
XpcP51612 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
XpcP51612 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
XpcP51612 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
XpcP51612 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
XpcP51612 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
XpcP51612 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
XpcP51612 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
XpcP51612 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
XpcP51612 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
XpcP51612 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
XpcP51612 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
XpcP51612 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
XpcP51612 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
XpcP51612 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
XpcP51612 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
XpcP51612 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
XpcP51612 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
XpcP51612 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
XpcP51612 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
XpcP51612 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
XpcP51612 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
XpcP51612 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
XpcP51612 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
XpcP51612 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
XpcP51612 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
XpcP51612 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
XpcP51612 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
XpcP51612 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
XpcP51612 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
XpcP51612 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
XpcP51612 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
XpcP51612 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
XpcP51612 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
XpcP51612 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
XpcP51612 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
XpcP51612 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
XpcP51612 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
XpcP51612 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
XpcP51612 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
XpcP51612 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
XpcP51612 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
XpcP51612 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
XpcP51612 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
XpcP51612 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
XpcP51612 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
XpcP51612 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
XpcP51612 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
XpcP51612 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms