Protein–RNA interactions for Protein: P51450

Rorc, Nuclear receptor ROR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RorcP51450 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RorcP51450 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RorcP51450 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RorcP51450 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RorcP51450 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RorcP51450 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RorcP51450 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RorcP51450 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RorcP51450 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RorcP51450 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RorcP51450 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RorcP51450 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RorcP51450 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RorcP51450 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RorcP51450 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RorcP51450 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RorcP51450 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RorcP51450 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RorcP51450 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RorcP51450 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RorcP51450 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RorcP51450 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RorcP51450 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RorcP51450 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RorcP51450 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RorcP51450 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RorcP51450 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RorcP51450 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RorcP51450 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RorcP51450 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RorcP51450 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RorcP51450 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RorcP51450 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RorcP51450 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RorcP51450 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RorcP51450 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RorcP51450 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RorcP51450 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RorcP51450 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RorcP51450 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RorcP51450 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RorcP51450 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RorcP51450 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RorcP51450 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RorcP51450 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RorcP51450 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RorcP51450 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RorcP51450 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RorcP51450 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RorcP51450 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RorcP51450 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RorcP51450 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RorcP51450 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RorcP51450 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RorcP51450 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RorcP51450 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RorcP51450 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RorcP51450 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RorcP51450 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RorcP51450 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RorcP51450 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RorcP51450 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RorcP51450 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RorcP51450 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RorcP51450 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RorcP51450 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RorcP51450 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RorcP51450 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RorcP51450 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RorcP51450 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RorcP51450 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RorcP51450 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RorcP51450 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RorcP51450 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RorcP51450 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RorcP51450 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RorcP51450 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RorcP51450 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RorcP51450 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RorcP51450 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RorcP51450 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RorcP51450 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RorcP51450 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RorcP51450 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RorcP51450 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RorcP51450 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RorcP51450 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RorcP51450 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RorcP51450 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RorcP51450 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RorcP51450 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RorcP51450 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RorcP51450 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RorcP51450 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RorcP51450 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RorcP51450 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RorcP51450 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RorcP51450 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RorcP51450 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RorcP51450 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms