Protein–RNA interactions for Protein: P50711

Defa13, Alpha-defensin 13, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa13P50711 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa13P50711 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa13P50711 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa13P50711 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa13P50711 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa13P50711 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa13P50711 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa13P50711 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa13P50711 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa13P50711 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa13P50711 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa13P50711 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa13P50711 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa13P50711 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa13P50711 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa13P50711 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa13P50711 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa13P50711 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa13P50711 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa13P50711 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa13P50711 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa13P50711 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa13P50711 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa13P50711 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa13P50711 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa13P50711 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa13P50711 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa13P50711 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa13P50711 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa13P50711 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa13P50711 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa13P50711 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa13P50711 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa13P50711 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa13P50711 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa13P50711 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa13P50711 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa13P50711 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa13P50711 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa13P50711 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa13P50711 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa13P50711 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa13P50711 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa13P50711 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa13P50711 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa13P50711 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa13P50711 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa13P50711 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa13P50711 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa13P50711 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa13P50711 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa13P50711 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa13P50711 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa13P50711 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa13P50711 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa13P50711 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa13P50711 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa13P50711 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa13P50711 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa13P50711 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa13P50711 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa13P50711 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa13P50711 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa13P50711 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa13P50711 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa13P50711 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa13P50711 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa13P50711 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa13P50711 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa13P50711 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa13P50711 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa13P50711 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa13P50711 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa13P50711 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa13P50711 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa13P50711 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa13P50711 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa13P50711 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa13P50711 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa13P50711 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa13P50711 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa13P50711 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa13P50711 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa13P50711 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa13P50711 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa13P50711 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa13P50711 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa13P50711 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Defa13P50711 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Defa13P50711 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Defa13P50711 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa13P50711 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa13P50711 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa13P50711 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa13P50711 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa13P50711 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa13P50711 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa13P50711 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa13P50711 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa13P50711 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms