Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FmodP50608 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FmodP50608 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FmodP50608 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FmodP50608 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
FmodP50608 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FmodP50608 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FmodP50608 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FmodP50608 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FmodP50608 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FmodP50608 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FmodP50608 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FmodP50608 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FmodP50608 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FmodP50608 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FmodP50608 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FmodP50608 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FmodP50608 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FmodP50608 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FmodP50608 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FmodP50608 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FmodP50608 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FmodP50608 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FmodP50608 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FmodP50608 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
FmodP50608 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
FmodP50608 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FmodP50608 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FmodP50608 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FmodP50608 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FmodP50608 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FmodP50608 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FmodP50608 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FmodP50608 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FmodP50608 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FmodP50608 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FmodP50608 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FmodP50608 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FmodP50608 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FmodP50608 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FmodP50608 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FmodP50608 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FmodP50608 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FmodP50608 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FmodP50608 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FmodP50608 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FmodP50608 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FmodP50608 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FmodP50608 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FmodP50608 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FmodP50608 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FmodP50608 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FmodP50608 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FmodP50608 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FmodP50608 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FmodP50608 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FmodP50608 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FmodP50608 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FmodP50608 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FmodP50608 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FmodP50608 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FmodP50608 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FmodP50608 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FmodP50608 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FmodP50608 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FmodP50608 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FmodP50608 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FmodP50608 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FmodP50608 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FmodP50608 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FmodP50608 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FmodP50608 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FmodP50608 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FmodP50608 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FmodP50608 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FmodP50608 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FmodP50608 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FmodP50608 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FmodP50608 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FmodP50608 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FmodP50608 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
FmodP50608 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FmodP50608 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FmodP50608 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FmodP50608 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FmodP50608 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FmodP50608 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FmodP50608 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FmodP50608 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FmodP50608 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FmodP50608 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FmodP50608 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FmodP50608 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FmodP50608 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FmodP50608 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FmodP50608 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FmodP50608 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FmodP50608 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FmodP50608 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FmodP50608 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms