Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LtbrP50284 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LtbrP50284 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LtbrP50284 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LtbrP50284 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LtbrP50284 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LtbrP50284 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LtbrP50284 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LtbrP50284 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LtbrP50284 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LtbrP50284 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LtbrP50284 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LtbrP50284 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LtbrP50284 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LtbrP50284 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LtbrP50284 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LtbrP50284 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LtbrP50284 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LtbrP50284 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LtbrP50284 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LtbrP50284 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LtbrP50284 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LtbrP50284 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LtbrP50284 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LtbrP50284 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LtbrP50284 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LtbrP50284 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LtbrP50284 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LtbrP50284 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LtbrP50284 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LtbrP50284 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LtbrP50284 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LtbrP50284 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LtbrP50284 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LtbrP50284 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LtbrP50284 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LtbrP50284 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LtbrP50284 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LtbrP50284 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LtbrP50284 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LtbrP50284 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LtbrP50284 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LtbrP50284 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
LtbrP50284 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
LtbrP50284 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LtbrP50284 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LtbrP50284 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LtbrP50284 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LtbrP50284 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LtbrP50284 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LtbrP50284 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LtbrP50284 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LtbrP50284 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LtbrP50284 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LtbrP50284 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LtbrP50284 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LtbrP50284 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LtbrP50284 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LtbrP50284 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LtbrP50284 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LtbrP50284 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LtbrP50284 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
LtbrP50284 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
LtbrP50284 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LtbrP50284 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LtbrP50284 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LtbrP50284 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LtbrP50284 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LtbrP50284 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LtbrP50284 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LtbrP50284 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LtbrP50284 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
LtbrP50284 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LtbrP50284 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LtbrP50284 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LtbrP50284 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LtbrP50284 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
LtbrP50284 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LtbrP50284 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LtbrP50284 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LtbrP50284 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LtbrP50284 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LtbrP50284 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LtbrP50284 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LtbrP50284 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LtbrP50284 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
LtbrP50284 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LtbrP50284 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LtbrP50284 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LtbrP50284 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
LtbrP50284 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
LtbrP50284 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LtbrP50284 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LtbrP50284 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LtbrP50284 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LtbrP50284 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LtbrP50284 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LtbrP50284 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LtbrP50284 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LtbrP50284 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
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