Protein–RNA interactions for Protein: P48437

Prox1, Prospero homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox1P48437 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prox1P48437 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prox1P48437 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prox1P48437 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prox1P48437 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prox1P48437 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prox1P48437 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prox1P48437 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Prox1P48437 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prox1P48437 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prox1P48437 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prox1P48437 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prox1P48437 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prox1P48437 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Prox1P48437 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prox1P48437 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prox1P48437 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prox1P48437 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prox1P48437 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prox1P48437 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prox1P48437 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prox1P48437 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prox1P48437 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prox1P48437 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prox1P48437 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Prox1P48437 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prox1P48437 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prox1P48437 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prox1P48437 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prox1P48437 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prox1P48437 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Prox1P48437 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prox1P48437 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prox1P48437 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prox1P48437 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prox1P48437 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prox1P48437 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Prox1P48437 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prox1P48437 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prox1P48437 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prox1P48437 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prox1P48437 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prox1P48437 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prox1P48437 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prox1P48437 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Prox1P48437 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prox1P48437 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prox1P48437 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prox1P48437 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prox1P48437 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prox1P48437 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prox1P48437 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prox1P48437 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Prox1P48437 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prox1P48437 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prox1P48437 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prox1P48437 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prox1P48437 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prox1P48437 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Prox1P48437 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prox1P48437 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prox1P48437 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prox1P48437 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prox1P48437 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prox1P48437 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prox1P48437 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prox1P48437 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prox1P48437 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prox1P48437 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prox1P48437 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prox1P48437 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prox1P48437 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prox1P48437 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prox1P48437 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prox1P48437 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prox1P48437 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prox1P48437 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prox1P48437 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prox1P48437 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prox1P48437 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prox1P48437 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prox1P48437 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prox1P48437 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prox1P48437 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prox1P48437 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prox1P48437 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prox1P48437 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prox1P48437 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prox1P48437 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prox1P48437 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prox1P48437 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prox1P48437 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Prox1P48437 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prox1P48437 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prox1P48437 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prox1P48437 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prox1P48437 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prox1P48437 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prox1P48437 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prox1P48437 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms