Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Abcd1P48410 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Abcd1P48410 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Abcd1P48410 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Abcd1P48410 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Abcd1P48410 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Abcd1P48410 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Abcd1P48410 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Abcd1P48410 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Abcd1P48410 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Abcd1P48410 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Abcd1P48410 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Abcd1P48410 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Abcd1P48410 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Abcd1P48410 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Abcd1P48410 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Abcd1P48410 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Abcd1P48410 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Abcd1P48410 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Abcd1P48410 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Abcd1P48410 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Abcd1P48410 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Abcd1P48410 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Abcd1P48410 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Abcd1P48410 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Abcd1P48410 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Abcd1P48410 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Abcd1P48410 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Abcd1P48410 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Abcd1P48410 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Abcd1P48410 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Abcd1P48410 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Abcd1P48410 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Abcd1P48410 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Abcd1P48410 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Abcd1P48410 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Abcd1P48410 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Abcd1P48410 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Abcd1P48410 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Abcd1P48410 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Abcd1P48410 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Abcd1P48410 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Abcd1P48410 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Abcd1P48410 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Abcd1P48410 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Abcd1P48410 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Abcd1P48410 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Abcd1P48410 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Abcd1P48410 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Abcd1P48410 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Abcd1P48410 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Abcd1P48410 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Abcd1P48410 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Abcd1P48410 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Abcd1P48410 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Abcd1P48410 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Abcd1P48410 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Abcd1P48410 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Abcd1P48410 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Abcd1P48410 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Abcd1P48410 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Abcd1P48410 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Abcd1P48410 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Abcd1P48410 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Abcd1P48410 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Abcd1P48410 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Abcd1P48410 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Abcd1P48410 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Abcd1P48410 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Abcd1P48410 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Abcd1P48410 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Abcd1P48410 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Abcd1P48410 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Abcd1P48410 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Abcd1P48410 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Abcd1P48410 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Abcd1P48410 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Abcd1P48410 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Abcd1P48410 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Abcd1P48410 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Abcd1P48410 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Abcd1P48410 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Abcd1P48410 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Abcd1P48410 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Abcd1P48410 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Abcd1P48410 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Abcd1P48410 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Abcd1P48410 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Abcd1P48410 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Abcd1P48410 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Abcd1P48410 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Abcd1P48410 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Abcd1P48410 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Abcd1P48410 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Abcd1P48410 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Abcd1P48410 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Abcd1P48410 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Abcd1P48410 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Abcd1P48410 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Abcd1P48410 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms