Protein–RNA interactions for Protein: P48299

Edn3, Endothelin-3, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edn3P48299 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Edn3P48299 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Edn3P48299 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Edn3P48299 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Edn3P48299 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Edn3P48299 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Edn3P48299 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Edn3P48299 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Edn3P48299 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Edn3P48299 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Edn3P48299 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Edn3P48299 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Edn3P48299 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Edn3P48299 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Edn3P48299 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Edn3P48299 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Edn3P48299 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Edn3P48299 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Edn3P48299 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Edn3P48299 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Edn3P48299 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Edn3P48299 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Edn3P48299 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Edn3P48299 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Edn3P48299 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Edn3P48299 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Edn3P48299 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Edn3P48299 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Edn3P48299 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Edn3P48299 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Edn3P48299 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Edn3P48299 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Edn3P48299 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Edn3P48299 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Edn3P48299 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Edn3P48299 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Edn3P48299 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Edn3P48299 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Edn3P48299 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Edn3P48299 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Edn3P48299 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Edn3P48299 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Edn3P48299 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Edn3P48299 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Edn3P48299 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Edn3P48299 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Edn3P48299 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Edn3P48299 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Edn3P48299 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Edn3P48299 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Edn3P48299 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Edn3P48299 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Edn3P48299 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Edn3P48299 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Edn3P48299 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Edn3P48299 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Edn3P48299 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Edn3P48299 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Edn3P48299 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Edn3P48299 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Edn3P48299 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Edn3P48299 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Edn3P48299 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Edn3P48299 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Edn3P48299 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Edn3P48299 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Edn3P48299 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Edn3P48299 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Edn3P48299 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Edn3P48299 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Edn3P48299 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Edn3P48299 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Edn3P48299 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Edn3P48299 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Edn3P48299 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Edn3P48299 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Edn3P48299 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Edn3P48299 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Edn3P48299 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Edn3P48299 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Edn3P48299 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Edn3P48299 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Edn3P48299 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Edn3P48299 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Edn3P48299 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Edn3P48299 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Edn3P48299 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Edn3P48299 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Edn3P48299 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Edn3P48299 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Edn3P48299 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Edn3P48299 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Edn3P48299 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Edn3P48299 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Edn3P48299 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Edn3P48299 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Edn3P48299 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Edn3P48299 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Edn3P48299 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Edn3P48299 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.6 ms