Protein–RNA interactions for Protein: P48298

Ccl11, Eotaxin, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl11P48298 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccl11P48298 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccl11P48298 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccl11P48298 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccl11P48298 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccl11P48298 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccl11P48298 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccl11P48298 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl11P48298 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl11P48298 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl11P48298 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl11P48298 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl11P48298 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl11P48298 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl11P48298 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl11P48298 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl11P48298 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl11P48298 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl11P48298 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl11P48298 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl11P48298 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl11P48298 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl11P48298 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl11P48298 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl11P48298 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl11P48298 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl11P48298 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccl11P48298 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccl11P48298 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccl11P48298 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccl11P48298 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccl11P48298 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccl11P48298 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccl11P48298 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccl11P48298 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccl11P48298 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccl11P48298 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccl11P48298 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccl11P48298 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccl11P48298 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccl11P48298 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccl11P48298 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccl11P48298 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccl11P48298 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccl11P48298 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccl11P48298 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccl11P48298 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccl11P48298 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccl11P48298 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccl11P48298 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccl11P48298 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccl11P48298 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccl11P48298 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccl11P48298 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccl11P48298 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccl11P48298 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccl11P48298 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccl11P48298 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccl11P48298 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccl11P48298 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccl11P48298 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccl11P48298 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccl11P48298 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccl11P48298 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccl11P48298 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccl11P48298 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccl11P48298 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccl11P48298 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccl11P48298 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccl11P48298 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccl11P48298 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccl11P48298 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccl11P48298 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccl11P48298 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccl11P48298 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccl11P48298 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccl11P48298 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccl11P48298 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccl11P48298 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccl11P48298 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccl11P48298 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccl11P48298 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccl11P48298 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccl11P48298 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccl11P48298 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccl11P48298 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccl11P48298 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccl11P48298 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccl11P48298 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccl11P48298 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccl11P48298 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccl11P48298 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccl11P48298 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccl11P48298 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccl11P48298 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccl11P48298 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccl11P48298 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccl11P48298 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccl11P48298 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccl11P48298 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms