Protein–RNA interactions for Protein: P47941

Crkl, Crk-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrklP47941 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CrklP47941 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CrklP47941 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CrklP47941 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CrklP47941 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CrklP47941 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CrklP47941 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CrklP47941 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CrklP47941 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CrklP47941 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CrklP47941 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CrklP47941 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CrklP47941 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CrklP47941 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CrklP47941 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CrklP47941 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CrklP47941 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CrklP47941 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CrklP47941 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CrklP47941 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CrklP47941 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CrklP47941 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CrklP47941 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CrklP47941 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CrklP47941 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CrklP47941 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CrklP47941 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CrklP47941 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CrklP47941 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CrklP47941 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CrklP47941 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CrklP47941 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CrklP47941 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CrklP47941 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CrklP47941 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CrklP47941 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CrklP47941 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CrklP47941 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CrklP47941 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CrklP47941 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CrklP47941 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CrklP47941 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CrklP47941 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CrklP47941 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CrklP47941 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CrklP47941 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CrklP47941 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CrklP47941 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CrklP47941 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CrklP47941 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CrklP47941 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CrklP47941 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CrklP47941 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CrklP47941 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CrklP47941 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CrklP47941 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CrklP47941 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CrklP47941 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CrklP47941 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CrklP47941 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CrklP47941 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CrklP47941 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CrklP47941 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CrklP47941 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CrklP47941 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CrklP47941 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CrklP47941 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CrklP47941 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CrklP47941 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CrklP47941 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CrklP47941 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CrklP47941 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CrklP47941 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CrklP47941 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CrklP47941 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CrklP47941 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CrklP47941 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CrklP47941 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CrklP47941 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CrklP47941 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CrklP47941 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CrklP47941 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CrklP47941 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CrklP47941 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CrklP47941 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CrklP47941 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CrklP47941 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CrklP47941 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CrklP47941 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CrklP47941 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CrklP47941 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CrklP47941 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CrklP47941 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CrklP47941 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CrklP47941 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CrklP47941 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CrklP47941 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CrklP47941 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CrklP47941 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CrklP47941 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms