Protein–RNA interactions for Protein: P46062

Sipa1, Signal-induced proliferation-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sipa1P46062 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sipa1P46062 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sipa1P46062 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Sipa1P46062 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Sipa1P46062 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sipa1P46062 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sipa1P46062 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sipa1P46062 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sipa1P46062 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sipa1P46062 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sipa1P46062 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sipa1P46062 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Sipa1P46062 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sipa1P46062 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sipa1P46062 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sipa1P46062 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sipa1P46062 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sipa1P46062 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sipa1P46062 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sipa1P46062 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sipa1P46062 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sipa1P46062 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sipa1P46062 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sipa1P46062 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sipa1P46062 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sipa1P46062 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sipa1P46062 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sipa1P46062 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Sipa1P46062 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sipa1P46062 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sipa1P46062 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sipa1P46062 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sipa1P46062 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sipa1P46062 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sipa1P46062 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sipa1P46062 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sipa1P46062 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Sipa1P46062 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sipa1P46062 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sipa1P46062 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sipa1P46062 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sipa1P46062 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sipa1P46062 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sipa1P46062 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sipa1P46062 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sipa1P46062 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sipa1P46062 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sipa1P46062 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sipa1P46062 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sipa1P46062 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sipa1P46062 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sipa1P46062 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sipa1P46062 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sipa1P46062 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sipa1P46062 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Sipa1P46062 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sipa1P46062 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sipa1P46062 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sipa1P46062 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sipa1P46062 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sipa1P46062 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sipa1P46062 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sipa1P46062 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sipa1P46062 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sipa1P46062 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sipa1P46062 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sipa1P46062 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sipa1P46062 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sipa1P46062 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sipa1P46062 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sipa1P46062 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sipa1P46062 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sipa1P46062 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Sipa1P46062 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sipa1P46062 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sipa1P46062 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sipa1P46062 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sipa1P46062 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sipa1P46062 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sipa1P46062 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sipa1P46062 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sipa1P46062 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sipa1P46062 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sipa1P46062 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sipa1P46062 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sipa1P46062 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sipa1P46062 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sipa1P46062 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Sipa1P46062 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sipa1P46062 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sipa1P46062 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sipa1P46062 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sipa1P46062 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sipa1P46062 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sipa1P46062 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sipa1P46062 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sipa1P46062 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sipa1P46062 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sipa1P46062 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sipa1P46062 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms