Protein–RNA interactions for Protein: P43252

Ptgir, Prostacyclin receptor, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgirP43252 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtgirP43252 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PtgirP43252 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtgirP43252 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtgirP43252 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtgirP43252 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtgirP43252 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtgirP43252 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtgirP43252 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtgirP43252 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtgirP43252 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtgirP43252 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtgirP43252 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtgirP43252 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtgirP43252 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtgirP43252 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtgirP43252 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtgirP43252 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtgirP43252 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtgirP43252 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtgirP43252 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PtgirP43252 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtgirP43252 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtgirP43252 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtgirP43252 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PtgirP43252 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtgirP43252 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtgirP43252 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtgirP43252 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtgirP43252 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtgirP43252 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtgirP43252 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtgirP43252 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtgirP43252 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PtgirP43252 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtgirP43252 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtgirP43252 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtgirP43252 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtgirP43252 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtgirP43252 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PtgirP43252 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PtgirP43252 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PtgirP43252 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtgirP43252 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtgirP43252 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtgirP43252 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PtgirP43252 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtgirP43252 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtgirP43252 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtgirP43252 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtgirP43252 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtgirP43252 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtgirP43252 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtgirP43252 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtgirP43252 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtgirP43252 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtgirP43252 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtgirP43252 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtgirP43252 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtgirP43252 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtgirP43252 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtgirP43252 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtgirP43252 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtgirP43252 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtgirP43252 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtgirP43252 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtgirP43252 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtgirP43252 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtgirP43252 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtgirP43252 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PtgirP43252 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtgirP43252 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtgirP43252 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtgirP43252 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtgirP43252 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtgirP43252 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtgirP43252 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtgirP43252 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtgirP43252 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtgirP43252 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtgirP43252 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtgirP43252 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtgirP43252 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtgirP43252 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtgirP43252 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtgirP43252 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PtgirP43252 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtgirP43252 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtgirP43252 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtgirP43252 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtgirP43252 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtgirP43252 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtgirP43252 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PtgirP43252 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtgirP43252 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PtgirP43252 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtgirP43252 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtgirP43252 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtgirP43252 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PtgirP43252 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms