Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtgfrP43117 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtgfrP43117 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PtgfrP43117 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PtgfrP43117 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtgfrP43117 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PtgfrP43117 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtgfrP43117 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtgfrP43117 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtgfrP43117 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtgfrP43117 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtgfrP43117 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtgfrP43117 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtgfrP43117 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtgfrP43117 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtgfrP43117 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtgfrP43117 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtgfrP43117 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtgfrP43117 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PtgfrP43117 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtgfrP43117 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtgfrP43117 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PtgfrP43117 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtgfrP43117 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtgfrP43117 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtgfrP43117 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtgfrP43117 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PtgfrP43117 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtgfrP43117 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtgfrP43117 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PtgfrP43117 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PtgfrP43117 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtgfrP43117 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtgfrP43117 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PtgfrP43117 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PtgfrP43117 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtgfrP43117 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtgfrP43117 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtgfrP43117 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtgfrP43117 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtgfrP43117 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtgfrP43117 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtgfrP43117 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtgfrP43117 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtgfrP43117 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtgfrP43117 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtgfrP43117 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtgfrP43117 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtgfrP43117 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtgfrP43117 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtgfrP43117 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtgfrP43117 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtgfrP43117 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtgfrP43117 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtgfrP43117 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtgfrP43117 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtgfrP43117 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtgfrP43117 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtgfrP43117 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtgfrP43117 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtgfrP43117 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtgfrP43117 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtgfrP43117 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtgfrP43117 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtgfrP43117 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PtgfrP43117 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtgfrP43117 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtgfrP43117 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtgfrP43117 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtgfrP43117 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtgfrP43117 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtgfrP43117 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtgfrP43117 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtgfrP43117 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtgfrP43117 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtgfrP43117 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtgfrP43117 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtgfrP43117 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PtgfrP43117 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtgfrP43117 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtgfrP43117 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtgfrP43117 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtgfrP43117 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtgfrP43117 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtgfrP43117 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PtgfrP43117 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PtgfrP43117 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtgfrP43117 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtgfrP43117 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtgfrP43117 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtgfrP43117 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtgfrP43117 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtgfrP43117 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtgfrP43117 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtgfrP43117 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtgfrP43117 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtgfrP43117 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PtgfrP43117 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtgfrP43117 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtgfrP43117 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms