Protein–RNA interactions for Protein: P41778

Pbx1, Pre-B-cell leukemia transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbx1P41778 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Pbx1P41778 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pbx1P41778 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pbx1P41778 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pbx1P41778 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pbx1P41778 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pbx1P41778 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pbx1P41778 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pbx1P41778 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pbx1P41778 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pbx1P41778 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pbx1P41778 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pbx1P41778 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pbx1P41778 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pbx1P41778 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pbx1P41778 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pbx1P41778 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pbx1P41778 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pbx1P41778 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pbx1P41778 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pbx1P41778 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pbx1P41778 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pbx1P41778 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pbx1P41778 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pbx1P41778 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pbx1P41778 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pbx1P41778 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pbx1P41778 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pbx1P41778 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pbx1P41778 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pbx1P41778 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pbx1P41778 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pbx1P41778 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pbx1P41778 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pbx1P41778 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pbx1P41778 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pbx1P41778 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pbx1P41778 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pbx1P41778 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pbx1P41778 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pbx1P41778 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pbx1P41778 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pbx1P41778 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pbx1P41778 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pbx1P41778 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pbx1P41778 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pbx1P41778 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pbx1P41778 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pbx1P41778 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pbx1P41778 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pbx1P41778 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pbx1P41778 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pbx1P41778 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pbx1P41778 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pbx1P41778 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pbx1P41778 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pbx1P41778 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pbx1P41778 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pbx1P41778 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pbx1P41778 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pbx1P41778 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pbx1P41778 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pbx1P41778 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Pbx1P41778 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pbx1P41778 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pbx1P41778 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pbx1P41778 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pbx1P41778 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pbx1P41778 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pbx1P41778 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pbx1P41778 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pbx1P41778 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pbx1P41778 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pbx1P41778 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pbx1P41778 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pbx1P41778 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pbx1P41778 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pbx1P41778 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pbx1P41778 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pbx1P41778 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pbx1P41778 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pbx1P41778 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pbx1P41778 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pbx1P41778 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pbx1P41778 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pbx1P41778 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pbx1P41778 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pbx1P41778 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pbx1P41778 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pbx1P41778 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pbx1P41778 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pbx1P41778 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pbx1P41778 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Pbx1P41778 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pbx1P41778 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pbx1P41778 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pbx1P41778 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Pbx1P41778 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pbx1P41778 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pbx1P41778 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms