Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnfsf9P41274 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnfsf9P41274 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnfsf9P41274 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnfsf9P41274 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnfsf9P41274 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnfsf9P41274 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnfsf9P41274 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnfsf9P41274 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tnfsf9P41274 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tnfsf9P41274 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnfsf9P41274 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnfsf9P41274 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnfsf9P41274 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnfsf9P41274 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnfsf9P41274 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnfsf9P41274 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnfsf9P41274 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnfsf9P41274 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnfsf9P41274 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnfsf9P41274 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnfsf9P41274 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnfsf9P41274 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnfsf9P41274 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnfsf9P41274 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnfsf9P41274 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnfsf9P41274 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnfsf9P41274 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnfsf9P41274 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnfsf9P41274 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnfsf9P41274 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnfsf9P41274 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnfsf9P41274 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnfsf9P41274 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnfsf9P41274 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnfsf9P41274 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnfsf9P41274 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnfsf9P41274 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnfsf9P41274 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnfsf9P41274 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnfsf9P41274 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnfsf9P41274 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnfsf9P41274 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnfsf9P41274 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnfsf9P41274 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnfsf9P41274 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnfsf9P41274 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnfsf9P41274 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnfsf9P41274 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnfsf9P41274 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnfsf9P41274 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnfsf9P41274 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnfsf9P41274 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnfsf9P41274 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnfsf9P41274 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnfsf9P41274 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnfsf9P41274 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnfsf9P41274 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnfsf9P41274 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnfsf9P41274 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnfsf9P41274 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnfsf9P41274 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnfsf9P41274 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnfsf9P41274 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnfsf9P41274 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnfsf9P41274 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnfsf9P41274 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnfsf9P41274 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnfsf9P41274 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnfsf9P41274 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnfsf9P41274 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnfsf9P41274 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnfsf9P41274 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnfsf9P41274 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnfsf9P41274 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnfsf9P41274 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnfsf9P41274 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnfsf9P41274 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnfsf9P41274 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnfsf9P41274 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnfsf9P41274 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnfsf9P41274 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnfsf9P41274 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnfsf9P41274 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnfsf9P41274 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnfsf9P41274 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnfsf9P41274 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnfsf9P41274 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnfsf9P41274 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnfsf9P41274 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnfsf9P41274 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnfsf9P41274 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnfsf9P41274 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnfsf9P41274 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnfsf9P41274 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnfsf9P41274 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnfsf9P41274 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnfsf9P41274 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tnfsf9P41274 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tnfsf9P41274 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms