Protein–RNA interactions for Protein: P40240

Cd9, CD9 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd9P40240 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cd9P40240 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cd9P40240 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cd9P40240 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cd9P40240 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cd9P40240 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cd9P40240 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cd9P40240 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Cd9P40240 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cd9P40240 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cd9P40240 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cd9P40240 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cd9P40240 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cd9P40240 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cd9P40240 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cd9P40240 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cd9P40240 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cd9P40240 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cd9P40240 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cd9P40240 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cd9P40240 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cd9P40240 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cd9P40240 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Cd9P40240 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cd9P40240 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cd9P40240 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cd9P40240 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cd9P40240 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cd9P40240 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cd9P40240 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cd9P40240 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cd9P40240 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cd9P40240 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cd9P40240 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cd9P40240 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cd9P40240 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cd9P40240 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cd9P40240 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Cd9P40240 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cd9P40240 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cd9P40240 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cd9P40240 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cd9P40240 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cd9P40240 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cd9P40240 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cd9P40240 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cd9P40240 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cd9P40240 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cd9P40240 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cd9P40240 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cd9P40240 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cd9P40240 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cd9P40240 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cd9P40240 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cd9P40240 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cd9P40240 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cd9P40240 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cd9P40240 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cd9P40240 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cd9P40240 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cd9P40240 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cd9P40240 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cd9P40240 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cd9P40240 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cd9P40240 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cd9P40240 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cd9P40240 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cd9P40240 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Cd9P40240 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cd9P40240 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cd9P40240 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cd9P40240 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cd9P40240 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Cd9P40240 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cd9P40240 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cd9P40240 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cd9P40240 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Cd9P40240 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cd9P40240 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cd9P40240 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cd9P40240 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cd9P40240 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cd9P40240 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cd9P40240 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cd9P40240 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cd9P40240 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cd9P40240 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cd9P40240 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cd9P40240 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cd9P40240 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cd9P40240 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cd9P40240 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cd9P40240 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cd9P40240 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cd9P40240 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Cd9P40240 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cd9P40240 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cd9P40240 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cd9P40240 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cd9P40240 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 584.9 ms