Protein–RNA interactions for Protein: P39429

Traf2, TNF receptor-associated factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf2P39429 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Traf2P39429 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Traf2P39429 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Traf2P39429 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Traf2P39429 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Traf2P39429 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Traf2P39429 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Traf2P39429 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Traf2P39429 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Traf2P39429 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Traf2P39429 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Traf2P39429 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Traf2P39429 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Traf2P39429 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Traf2P39429 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Traf2P39429 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Traf2P39429 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Traf2P39429 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Traf2P39429 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Traf2P39429 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Traf2P39429 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Traf2P39429 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Traf2P39429 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Traf2P39429 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Traf2P39429 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Traf2P39429 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Traf2P39429 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Traf2P39429 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Traf2P39429 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Traf2P39429 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Traf2P39429 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Traf2P39429 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Traf2P39429 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Traf2P39429 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Traf2P39429 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Traf2P39429 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Traf2P39429 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Traf2P39429 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Traf2P39429 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Traf2P39429 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Traf2P39429 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Traf2P39429 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Traf2P39429 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Traf2P39429 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Traf2P39429 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Traf2P39429 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Traf2P39429 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Traf2P39429 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Traf2P39429 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Traf2P39429 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Traf2P39429 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Traf2P39429 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Traf2P39429 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Traf2P39429 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Traf2P39429 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Traf2P39429 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Traf2P39429 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Traf2P39429 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Traf2P39429 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Traf2P39429 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Traf2P39429 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Traf2P39429 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Traf2P39429 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Traf2P39429 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Traf2P39429 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Traf2P39429 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Traf2P39429 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Traf2P39429 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Traf2P39429 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Traf2P39429 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Traf2P39429 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Traf2P39429 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Traf2P39429 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Traf2P39429 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Traf2P39429 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Traf2P39429 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Traf2P39429 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Traf2P39429 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Traf2P39429 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Traf2P39429 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Traf2P39429 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Traf2P39429 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Traf2P39429 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Traf2P39429 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Traf2P39429 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Traf2P39429 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Traf2P39429 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Traf2P39429 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Traf2P39429 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Traf2P39429 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Traf2P39429 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Traf2P39429 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Traf2P39429 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Traf2P39429 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Traf2P39429 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Traf2P39429 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Traf2P39429 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Traf2P39429 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Traf2P39429 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Traf2P39429 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms