Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Grik2P39087 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Grik2P39087 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Grik2P39087 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Grik2P39087 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Grik2P39087 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Grik2P39087 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Grik2P39087 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Grik2P39087 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Grik2P39087 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Grik2P39087 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Grik2P39087 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Grik2P39087 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Grik2P39087 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Grik2P39087 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Grik2P39087 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Grik2P39087 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Grik2P39087 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Grik2P39087 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Grik2P39087 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Grik2P39087 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Grik2P39087 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Grik2P39087 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Grik2P39087 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Grik2P39087 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Grik2P39087 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Grik2P39087 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Grik2P39087 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Grik2P39087 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Grik2P39087 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Grik2P39087 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Grik2P39087 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Grik2P39087 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Grik2P39087 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Grik2P39087 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Grik2P39087 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Grik2P39087 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Grik2P39087 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Grik2P39087 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Grik2P39087 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Grik2P39087 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Grik2P39087 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Grik2P39087 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Grik2P39087 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Grik2P39087 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Grik2P39087 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Grik2P39087 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Grik2P39087 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Grik2P39087 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Grik2P39087 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Grik2P39087 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Grik2P39087 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Grik2P39087 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Grik2P39087 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Grik2P39087 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Grik2P39087 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Grik2P39087 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Grik2P39087 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Grik2P39087 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Grik2P39087 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Grik2P39087 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Grik2P39087 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Grik2P39087 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Grik2P39087 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Grik2P39087 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Grik2P39087 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Grik2P39087 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Grik2P39087 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Grik2P39087 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Grik2P39087 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Grik2P39087 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Grik2P39087 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Grik2P39087 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Grik2P39087 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Grik2P39087 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Grik2P39087 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Grik2P39087 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Grik2P39087 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Grik2P39087 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Grik2P39087 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Grik2P39087 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Grik2P39087 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Grik2P39087 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Grik2P39087 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Grik2P39087 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Grik2P39087 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Grik2P39087 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Grik2P39087 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Grik2P39087 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Grik2P39087 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Grik2P39087 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Grik2P39087 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Grik2P39087 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Grik2P39087 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Grik2P39087 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Grik2P39087 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Grik2P39087 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Grik2P39087 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Grik2P39087 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Grik2P39087 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms