Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lig1P37913 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lig1P37913 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lig1P37913 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Lig1P37913 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Lig1P37913 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Lig1P37913 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lig1P37913 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lig1P37913 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lig1P37913 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lig1P37913 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Lig1P37913 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lig1P37913 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lig1P37913 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lig1P37913 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lig1P37913 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lig1P37913 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lig1P37913 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lig1P37913 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lig1P37913 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lig1P37913 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lig1P37913 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lig1P37913 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lig1P37913 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lig1P37913 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lig1P37913 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lig1P37913 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lig1P37913 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lig1P37913 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lig1P37913 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lig1P37913 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lig1P37913 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lig1P37913 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lig1P37913 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lig1P37913 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lig1P37913 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lig1P37913 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lig1P37913 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lig1P37913 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lig1P37913 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lig1P37913 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lig1P37913 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lig1P37913 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lig1P37913 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Lig1P37913 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lig1P37913 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lig1P37913 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lig1P37913 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lig1P37913 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lig1P37913 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lig1P37913 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lig1P37913 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lig1P37913 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lig1P37913 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lig1P37913 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lig1P37913 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lig1P37913 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lig1P37913 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lig1P37913 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lig1P37913 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lig1P37913 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lig1P37913 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lig1P37913 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lig1P37913 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lig1P37913 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lig1P37913 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lig1P37913 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lig1P37913 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lig1P37913 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lig1P37913 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lig1P37913 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Lig1P37913 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lig1P37913 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lig1P37913 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lig1P37913 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lig1P37913 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lig1P37913 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lig1P37913 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lig1P37913 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lig1P37913 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lig1P37913 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lig1P37913 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lig1P37913 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lig1P37913 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lig1P37913 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lig1P37913 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lig1P37913 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lig1P37913 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lig1P37913 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lig1P37913 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lig1P37913 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lig1P37913 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lig1P37913 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lig1P37913 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lig1P37913 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lig1P37913 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lig1P37913 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Lig1P37913 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Lig1P37913 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lig1P37913 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms