Protein–RNA interactions for Protein: P35710

Sox5, Transcription factor SOX-5, mousemouse

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox5P35710 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sox5P35710 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sox5P35710 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sox5P35710 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sox5P35710 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sox5P35710 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sox5P35710 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sox5P35710 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sox5P35710 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sox5P35710 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sox5P35710 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sox5P35710 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sox5P35710 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sox5P35710 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sox5P35710 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sox5P35710 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sox5P35710 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sox5P35710 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sox5P35710 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sox5P35710 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sox5P35710 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sox5P35710 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sox5P35710 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sox5P35710 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sox5P35710 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sox5P35710 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sox5P35710 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Sox5P35710 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sox5P35710 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sox5P35710 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sox5P35710 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sox5P35710 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sox5P35710 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sox5P35710 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sox5P35710 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sox5P35710 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sox5P35710 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sox5P35710 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sox5P35710 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sox5P35710 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sox5P35710 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sox5P35710 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sox5P35710 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sox5P35710 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sox5P35710 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sox5P35710 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sox5P35710 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sox5P35710 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sox5P35710 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Sox5P35710 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sox5P35710 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sox5P35710 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sox5P35710 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sox5P35710 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sox5P35710 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sox5P35710 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sox5P35710 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sox5P35710 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sox5P35710 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sox5P35710 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sox5P35710 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sox5P35710 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sox5P35710 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sox5P35710 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sox5P35710 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sox5P35710 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sox5P35710 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sox5P35710 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sox5P35710 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Sox5P35710 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sox5P35710 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sox5P35710 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Sox5P35710 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sox5P35710 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sox5P35710 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sox5P35710 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sox5P35710 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sox5P35710 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sox5P35710 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Sox5P35710 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sox5P35710 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Sox5P35710 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sox5P35710 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sox5P35710 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sox5P35710 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sox5P35710 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sox5P35710 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sox5P35710 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sox5P35710 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sox5P35710 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sox5P35710 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sox5P35710 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sox5P35710 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sox5P35710 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sox5P35710 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sox5P35710 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sox5P35710 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sox5P35710 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sox5P35710 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sox5P35710 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92 ms