Protein–RNA interactions for Protein: P33609

Pola1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola1P33609 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Pola1P33609 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Pola1P33609 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Pola1P33609 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Pola1P33609 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Pola1P33609 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Pola1P33609 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Pola1P33609 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Pola1P33609 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Pola1P33609 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Pola1P33609 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Pola1P33609 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Pola1P33609 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Pola1P33609 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Pola1P33609 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Pola1P33609 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Pola1P33609 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Pola1P33609 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Pola1P33609 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Pola1P33609 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Pola1P33609 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Pola1P33609 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Pola1P33609 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Pola1P33609 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Pola1P33609 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Pola1P33609 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Pola1P33609 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Pola1P33609 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Pola1P33609 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Pola1P33609 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Pola1P33609 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Pola1P33609 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Pola1P33609 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Pola1P33609 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Pola1P33609 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Pola1P33609 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Pola1P33609 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Pola1P33609 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Pola1P33609 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Pola1P33609 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Pola1P33609 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Pola1P33609 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Pola1P33609 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Pola1P33609 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Pola1P33609 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Pola1P33609 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Pola1P33609 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Pola1P33609 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Pola1P33609 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Pola1P33609 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Pola1P33609 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Pola1P33609 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Pola1P33609 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Pola1P33609 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Pola1P33609 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Pola1P33609 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Pola1P33609 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Pola1P33609 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Pola1P33609 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Pola1P33609 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Pola1P33609 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Pola1P33609 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Pola1P33609 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Pola1P33609 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Pola1P33609 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Pola1P33609 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Pola1P33609 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Pola1P33609 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Pola1P33609 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Pola1P33609 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Pola1P33609 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Pola1P33609 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Pola1P33609 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Pola1P33609 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Pola1P33609 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Pola1P33609 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Pola1P33609 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Pola1P33609 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Pola1P33609 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Pola1P33609 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Pola1P33609 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Pola1P33609 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Pola1P33609 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Pola1P33609 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Pola1P33609 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Pola1P33609 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Pola1P33609 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Pola1P33609 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Pola1P33609 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Pola1P33609 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Pola1P33609 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Pola1P33609 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Pola1P33609 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Pola1P33609 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Pola1P33609 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Pola1P33609 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Pola1P33609 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Pola1P33609 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Pola1P33609 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Pola1P33609 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms