Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nedd1P33215 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nedd1P33215 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nedd1P33215 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nedd1P33215 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nedd1P33215 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nedd1P33215 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Nedd1P33215 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nedd1P33215 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nedd1P33215 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nedd1P33215 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nedd1P33215 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nedd1P33215 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nedd1P33215 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nedd1P33215 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nedd1P33215 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nedd1P33215 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Nedd1P33215 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nedd1P33215 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Nedd1P33215 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nedd1P33215 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nedd1P33215 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nedd1P33215 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nedd1P33215 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nedd1P33215 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nedd1P33215 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nedd1P33215 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nedd1P33215 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nedd1P33215 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nedd1P33215 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Nedd1P33215 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nedd1P33215 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nedd1P33215 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nedd1P33215 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nedd1P33215 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nedd1P33215 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nedd1P33215 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nedd1P33215 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nedd1P33215 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nedd1P33215 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nedd1P33215 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Nedd1P33215 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nedd1P33215 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nedd1P33215 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nedd1P33215 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nedd1P33215 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nedd1P33215 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nedd1P33215 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nedd1P33215 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nedd1P33215 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nedd1P33215 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nedd1P33215 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nedd1P33215 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Nedd1P33215 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nedd1P33215 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Nedd1P33215 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nedd1P33215 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nedd1P33215 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nedd1P33215 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nedd1P33215 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nedd1P33215 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nedd1P33215 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nedd1P33215 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nedd1P33215 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nedd1P33215 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nedd1P33215 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nedd1P33215 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nedd1P33215 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nedd1P33215 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nedd1P33215 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nedd1P33215 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Nedd1P33215 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nedd1P33215 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nedd1P33215 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nedd1P33215 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Nedd1P33215 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nedd1P33215 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Nedd1P33215 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nedd1P33215 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nedd1P33215 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nedd1P33215 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nedd1P33215 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nedd1P33215 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nedd1P33215 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nedd1P33215 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nedd1P33215 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nedd1P33215 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nedd1P33215 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nedd1P33215 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nedd1P33215 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Nedd1P33215 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Nedd1P33215 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nedd1P33215 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nedd1P33215 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nedd1P33215 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nedd1P33215 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nedd1P33215 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nedd1P33215 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nedd1P33215 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nedd1P33215 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms