Protein–RNA interactions for Protein: P30282

Ccnd3, G1/S-specific cyclin-D3, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd3P30282 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccnd3P30282 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccnd3P30282 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccnd3P30282 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccnd3P30282 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccnd3P30282 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccnd3P30282 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccnd3P30282 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccnd3P30282 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccnd3P30282 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccnd3P30282 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccnd3P30282 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccnd3P30282 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccnd3P30282 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccnd3P30282 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccnd3P30282 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccnd3P30282 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccnd3P30282 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccnd3P30282 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccnd3P30282 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccnd3P30282 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccnd3P30282 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccnd3P30282 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccnd3P30282 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccnd3P30282 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccnd3P30282 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccnd3P30282 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccnd3P30282 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccnd3P30282 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccnd3P30282 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccnd3P30282 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccnd3P30282 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccnd3P30282 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccnd3P30282 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccnd3P30282 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccnd3P30282 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccnd3P30282 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccnd3P30282 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccnd3P30282 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccnd3P30282 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccnd3P30282 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccnd3P30282 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccnd3P30282 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccnd3P30282 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccnd3P30282 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccnd3P30282 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccnd3P30282 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccnd3P30282 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccnd3P30282 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccnd3P30282 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccnd3P30282 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccnd3P30282 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccnd3P30282 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccnd3P30282 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccnd3P30282 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccnd3P30282 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccnd3P30282 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccnd3P30282 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccnd3P30282 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccnd3P30282 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccnd3P30282 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ccnd3P30282 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccnd3P30282 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccnd3P30282 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccnd3P30282 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccnd3P30282 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccnd3P30282 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccnd3P30282 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccnd3P30282 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccnd3P30282 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccnd3P30282 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccnd3P30282 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccnd3P30282 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccnd3P30282 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccnd3P30282 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccnd3P30282 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccnd3P30282 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccnd3P30282 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccnd3P30282 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccnd3P30282 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccnd3P30282 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccnd3P30282 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccnd3P30282 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccnd3P30282 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccnd3P30282 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccnd3P30282 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccnd3P30282 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccnd3P30282 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccnd3P30282 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccnd3P30282 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccnd3P30282 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccnd3P30282 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccnd3P30282 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccnd3P30282 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccnd3P30282 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccnd3P30282 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccnd3P30282 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccnd3P30282 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccnd3P30282 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccnd3P30282 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 337.3 ms