Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Cnga1P29974 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cnga1P29974 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cnga1P29974 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cnga1P29974 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cnga1P29974 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cnga1P29974 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cnga1P29974 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cnga1P29974 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cnga1P29974 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cnga1P29974 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cnga1P29974 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cnga1P29974 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cnga1P29974 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cnga1P29974 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cnga1P29974 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cnga1P29974 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cnga1P29974 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cnga1P29974 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
Cnga1P29974 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cnga1P29974 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cnga1P29974 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cnga1P29974 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cnga1P29974 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cnga1P29974 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cnga1P29974 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cnga1P29974 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cnga1P29974 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cnga1P29974 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Cnga1P29974 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cnga1P29974 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cnga1P29974 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cnga1P29974 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cnga1P29974 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cnga1P29974 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cnga1P29974 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cnga1P29974 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cnga1P29974 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cnga1P29974 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cnga1P29974 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cnga1P29974 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cnga1P29974 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cnga1P29974 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cnga1P29974 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cnga1P29974 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Cnga1P29974 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cnga1P29974 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cnga1P29974 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cnga1P29974 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cnga1P29974 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cnga1P29974 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cnga1P29974 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Cnga1P29974 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cnga1P29974 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cnga1P29974 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cnga1P29974 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cnga1P29974 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cnga1P29974 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cnga1P29974 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cnga1P29974 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cnga1P29974 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cnga1P29974 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cnga1P29974 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cnga1P29974 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Cnga1P29974 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cnga1P29974 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cnga1P29974 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cnga1P29974 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cnga1P29974 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cnga1P29974 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cnga1P29974 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cnga1P29974 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cnga1P29974 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cnga1P29974 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cnga1P29974 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cnga1P29974 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Cnga1P29974 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cnga1P29974 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cnga1P29974 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cnga1P29974 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cnga1P29974 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cnga1P29974 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cnga1P29974 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cnga1P29974 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cnga1P29974 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cnga1P29974 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cnga1P29974 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cnga1P29974 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cnga1P29974 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cnga1P29974 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cnga1P29974 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cnga1P29974 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cnga1P29974 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cnga1P29974 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Cnga1P29974 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cnga1P29974 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cnga1P29974 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cnga1P29974 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cnga1P29974 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cnga1P29974 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms