Protein–RNA interactions for Protein: P28667

Marcksl1, MARCKS-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Marcksl1P28667 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Marcksl1P28667 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Marcksl1P28667 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Marcksl1P28667 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Marcksl1P28667 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Marcksl1P28667 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Marcksl1P28667 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Marcksl1P28667 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Marcksl1P28667 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Marcksl1P28667 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Marcksl1P28667 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Marcksl1P28667 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Marcksl1P28667 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Marcksl1P28667 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Marcksl1P28667 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Marcksl1P28667 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Marcksl1P28667 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Marcksl1P28667 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Marcksl1P28667 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Marcksl1P28667 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Marcksl1P28667 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Marcksl1P28667 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Marcksl1P28667 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Marcksl1P28667 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Marcksl1P28667 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Marcksl1P28667 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Marcksl1P28667 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Marcksl1P28667 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Marcksl1P28667 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Marcksl1P28667 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Marcksl1P28667 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Marcksl1P28667 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Marcksl1P28667 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Marcksl1P28667 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Marcksl1P28667 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Marcksl1P28667 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Marcksl1P28667 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Marcksl1P28667 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Marcksl1P28667 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Marcksl1P28667 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Marcksl1P28667 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Marcksl1P28667 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Marcksl1P28667 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Marcksl1P28667 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Marcksl1P28667 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Marcksl1P28667 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Marcksl1P28667 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Marcksl1P28667 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Marcksl1P28667 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Marcksl1P28667 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Marcksl1P28667 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Marcksl1P28667 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Marcksl1P28667 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Marcksl1P28667 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Marcksl1P28667 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Marcksl1P28667 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Marcksl1P28667 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Marcksl1P28667 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Marcksl1P28667 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Marcksl1P28667 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Marcksl1P28667 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Marcksl1P28667 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Marcksl1P28667 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Marcksl1P28667 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Marcksl1P28667 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Marcksl1P28667 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Marcksl1P28667 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Marcksl1P28667 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Marcksl1P28667 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Marcksl1P28667 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Marcksl1P28667 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Marcksl1P28667 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Marcksl1P28667 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Marcksl1P28667 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Marcksl1P28667 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Marcksl1P28667 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Marcksl1P28667 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Marcksl1P28667 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Marcksl1P28667 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Marcksl1P28667 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Marcksl1P28667 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Marcksl1P28667 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Marcksl1P28667 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Marcksl1P28667 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Marcksl1P28667 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Marcksl1P28667 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Marcksl1P28667 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Marcksl1P28667 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Marcksl1P28667 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Marcksl1P28667 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Marcksl1P28667 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Marcksl1P28667 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Marcksl1P28667 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Marcksl1P28667 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Marcksl1P28667 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Marcksl1P28667 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Marcksl1P28667 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Marcksl1P28667 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Marcksl1P28667 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Marcksl1P28667 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms