Protein–RNA interactions for Protein: P28563

Dusp1, Dual specificity protein phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dusp1P28563 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dusp1P28563 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dusp1P28563 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dusp1P28563 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dusp1P28563 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dusp1P28563 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dusp1P28563 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dusp1P28563 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dusp1P28563 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dusp1P28563 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dusp1P28563 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dusp1P28563 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dusp1P28563 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dusp1P28563 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dusp1P28563 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dusp1P28563 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dusp1P28563 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dusp1P28563 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dusp1P28563 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dusp1P28563 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dusp1P28563 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dusp1P28563 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dusp1P28563 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dusp1P28563 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dusp1P28563 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dusp1P28563 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Dusp1P28563 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Dusp1P28563 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dusp1P28563 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dusp1P28563 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dusp1P28563 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Dusp1P28563 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dusp1P28563 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dusp1P28563 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dusp1P28563 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dusp1P28563 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dusp1P28563 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dusp1P28563 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dusp1P28563 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dusp1P28563 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dusp1P28563 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dusp1P28563 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dusp1P28563 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dusp1P28563 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dusp1P28563 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dusp1P28563 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dusp1P28563 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dusp1P28563 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dusp1P28563 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Dusp1P28563 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Dusp1P28563 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Dusp1P28563 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Dusp1P28563 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dusp1P28563 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dusp1P28563 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dusp1P28563 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dusp1P28563 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dusp1P28563 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dusp1P28563 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dusp1P28563 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dusp1P28563 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dusp1P28563 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dusp1P28563 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dusp1P28563 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dusp1P28563 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dusp1P28563 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dusp1P28563 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dusp1P28563 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dusp1P28563 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dusp1P28563 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dusp1P28563 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dusp1P28563 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dusp1P28563 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dusp1P28563 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dusp1P28563 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dusp1P28563 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dusp1P28563 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dusp1P28563 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dusp1P28563 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dusp1P28563 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dusp1P28563 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dusp1P28563 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dusp1P28563 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dusp1P28563 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dusp1P28563 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Dusp1P28563 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dusp1P28563 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dusp1P28563 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dusp1P28563 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dusp1P28563 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dusp1P28563 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dusp1P28563 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dusp1P28563 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dusp1P28563 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dusp1P28563 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dusp1P28563 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dusp1P28563 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dusp1P28563 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dusp1P28563 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dusp1P28563 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms