Protein–RNA interactions for Protein: P28235

Gja4, Gap junction alpha-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja4P28235 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gja4P28235 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gja4P28235 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gja4P28235 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gja4P28235 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gja4P28235 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gja4P28235 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gja4P28235 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gja4P28235 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gja4P28235 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gja4P28235 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gja4P28235 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gja4P28235 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gja4P28235 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gja4P28235 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gja4P28235 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gja4P28235 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gja4P28235 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gja4P28235 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gja4P28235 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gja4P28235 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gja4P28235 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Gja4P28235 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gja4P28235 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gja4P28235 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gja4P28235 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gja4P28235 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gja4P28235 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gja4P28235 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gja4P28235 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gja4P28235 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gja4P28235 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gja4P28235 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gja4P28235 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gja4P28235 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Gja4P28235 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gja4P28235 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gja4P28235 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gja4P28235 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gja4P28235 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gja4P28235 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gja4P28235 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gja4P28235 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gja4P28235 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Gja4P28235 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gja4P28235 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gja4P28235 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gja4P28235 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gja4P28235 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gja4P28235 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Gja4P28235 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gja4P28235 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gja4P28235 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gja4P28235 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gja4P28235 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gja4P28235 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gja4P28235 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gja4P28235 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Gja4P28235 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Gja4P28235 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gja4P28235 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gja4P28235 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gja4P28235 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gja4P28235 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gja4P28235 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gja4P28235 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Gja4P28235 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gja4P28235 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gja4P28235 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gja4P28235 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gja4P28235 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gja4P28235 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gja4P28235 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gja4P28235 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gja4P28235 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gja4P28235 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gja4P28235 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Gja4P28235 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gja4P28235 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gja4P28235 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gja4P28235 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gja4P28235 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gja4P28235 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gja4P28235 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gja4P28235 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gja4P28235 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gja4P28235 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gja4P28235 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gja4P28235 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gja4P28235 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gja4P28235 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gja4P28235 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gja4P28235 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gja4P28235 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gja4P28235 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gja4P28235 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gja4P28235 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gja4P28235 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gja4P28235 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gja4P28235 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms