Protein–RNA interactions for Protein: P27870

Vav1, Proto-oncogene vav, mousemouse

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav1P27870 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vav1P27870 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vav1P27870 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vav1P27870 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vav1P27870 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vav1P27870 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Vav1P27870 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vav1P27870 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vav1P27870 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vav1P27870 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vav1P27870 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vav1P27870 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vav1P27870 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Vav1P27870 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vav1P27870 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vav1P27870 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vav1P27870 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vav1P27870 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vav1P27870 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vav1P27870 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vav1P27870 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vav1P27870 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vav1P27870 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Vav1P27870 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Vav1P27870 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Vav1P27870 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Vav1P27870 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vav1P27870 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vav1P27870 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vav1P27870 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vav1P27870 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vav1P27870 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vav1P27870 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vav1P27870 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vav1P27870 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vav1P27870 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vav1P27870 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vav1P27870 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vav1P27870 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vav1P27870 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Vav1P27870 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vav1P27870 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vav1P27870 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vav1P27870 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vav1P27870 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vav1P27870 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vav1P27870 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vav1P27870 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vav1P27870 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vav1P27870 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vav1P27870 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vav1P27870 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vav1P27870 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vav1P27870 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vav1P27870 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vav1P27870 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vav1P27870 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vav1P27870 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vav1P27870 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vav1P27870 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vav1P27870 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vav1P27870 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vav1P27870 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vav1P27870 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vav1P27870 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vav1P27870 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vav1P27870 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vav1P27870 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vav1P27870 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vav1P27870 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vav1P27870 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vav1P27870 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vav1P27870 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vav1P27870 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vav1P27870 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vav1P27870 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vav1P27870 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vav1P27870 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vav1P27870 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vav1P27870 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Vav1P27870 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Vav1P27870 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Vav1P27870 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vav1P27870 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vav1P27870 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Vav1P27870 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vav1P27870 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vav1P27870 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vav1P27870 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vav1P27870 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vav1P27870 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vav1P27870 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vav1P27870 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vav1P27870 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vav1P27870 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vav1P27870 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vav1P27870 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vav1P27870 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vav1P27870 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vav1P27870 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms