Protein–RNA interactions for Protein: P27790

Cenpb, Major centromere autoantigen B, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpbP27790 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CenpbP27790 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CenpbP27790 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CenpbP27790 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CenpbP27790 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CenpbP27790 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CenpbP27790 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CenpbP27790 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CenpbP27790 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CenpbP27790 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CenpbP27790 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CenpbP27790 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CenpbP27790 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CenpbP27790 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CenpbP27790 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CenpbP27790 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CenpbP27790 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CenpbP27790 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CenpbP27790 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CenpbP27790 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CenpbP27790 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CenpbP27790 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CenpbP27790 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CenpbP27790 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CenpbP27790 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CenpbP27790 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CenpbP27790 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CenpbP27790 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CenpbP27790 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CenpbP27790 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CenpbP27790 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CenpbP27790 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CenpbP27790 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CenpbP27790 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CenpbP27790 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CenpbP27790 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CenpbP27790 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CenpbP27790 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CenpbP27790 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
CenpbP27790 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CenpbP27790 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CenpbP27790 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CenpbP27790 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CenpbP27790 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CenpbP27790 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CenpbP27790 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CenpbP27790 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CenpbP27790 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CenpbP27790 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CenpbP27790 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CenpbP27790 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CenpbP27790 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CenpbP27790 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CenpbP27790 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CenpbP27790 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CenpbP27790 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CenpbP27790 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CenpbP27790 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CenpbP27790 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CenpbP27790 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CenpbP27790 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CenpbP27790 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CenpbP27790 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CenpbP27790 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CenpbP27790 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CenpbP27790 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CenpbP27790 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CenpbP27790 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CenpbP27790 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CenpbP27790 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CenpbP27790 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CenpbP27790 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CenpbP27790 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CenpbP27790 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CenpbP27790 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CenpbP27790 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CenpbP27790 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CenpbP27790 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CenpbP27790 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CenpbP27790 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CenpbP27790 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CenpbP27790 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CenpbP27790 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CenpbP27790 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CenpbP27790 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CenpbP27790 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CenpbP27790 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CenpbP27790 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CenpbP27790 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CenpbP27790 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CenpbP27790 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CenpbP27790 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CenpbP27790 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CenpbP27790 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CenpbP27790 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CenpbP27790 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CenpbP27790 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CenpbP27790 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CenpbP27790 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CenpbP27790 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms