Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PdgfraP26618 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PdgfraP26618 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PdgfraP26618 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PdgfraP26618 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PdgfraP26618 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PdgfraP26618 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PdgfraP26618 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PdgfraP26618 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PdgfraP26618 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PdgfraP26618 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PdgfraP26618 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PdgfraP26618 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PdgfraP26618 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PdgfraP26618 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PdgfraP26618 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PdgfraP26618 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PdgfraP26618 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PdgfraP26618 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PdgfraP26618 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PdgfraP26618 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PdgfraP26618 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PdgfraP26618 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PdgfraP26618 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PdgfraP26618 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PdgfraP26618 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PdgfraP26618 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PdgfraP26618 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PdgfraP26618 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PdgfraP26618 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PdgfraP26618 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PdgfraP26618 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PdgfraP26618 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PdgfraP26618 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PdgfraP26618 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PdgfraP26618 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PdgfraP26618 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PdgfraP26618 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PdgfraP26618 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PdgfraP26618 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PdgfraP26618 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PdgfraP26618 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PdgfraP26618 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PdgfraP26618 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PdgfraP26618 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PdgfraP26618 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PdgfraP26618 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PdgfraP26618 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PdgfraP26618 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PdgfraP26618 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PdgfraP26618 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PdgfraP26618 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PdgfraP26618 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PdgfraP26618 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PdgfraP26618 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PdgfraP26618 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PdgfraP26618 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PdgfraP26618 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PdgfraP26618 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PdgfraP26618 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PdgfraP26618 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PdgfraP26618 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PdgfraP26618 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PdgfraP26618 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PdgfraP26618 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PdgfraP26618 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PdgfraP26618 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PdgfraP26618 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PdgfraP26618 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PdgfraP26618 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PdgfraP26618 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PdgfraP26618 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PdgfraP26618 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PdgfraP26618 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PdgfraP26618 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PdgfraP26618 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PdgfraP26618 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PdgfraP26618 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PdgfraP26618 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PdgfraP26618 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PdgfraP26618 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PdgfraP26618 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PdgfraP26618 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PdgfraP26618 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PdgfraP26618 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PdgfraP26618 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PdgfraP26618 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PdgfraP26618 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PdgfraP26618 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PdgfraP26618 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PdgfraP26618 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PdgfraP26618 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PdgfraP26618 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PdgfraP26618 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PdgfraP26618 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PdgfraP26618 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PdgfraP26618 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PdgfraP26618 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PdgfraP26618 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PdgfraP26618 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms