Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ChgaP26339 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ChgaP26339 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ChgaP26339 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ChgaP26339 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ChgaP26339 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ChgaP26339 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ChgaP26339 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ChgaP26339 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ChgaP26339 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ChgaP26339 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ChgaP26339 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ChgaP26339 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ChgaP26339 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ChgaP26339 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ChgaP26339 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ChgaP26339 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ChgaP26339 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ChgaP26339 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ChgaP26339 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ChgaP26339 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ChgaP26339 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ChgaP26339 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ChgaP26339 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ChgaP26339 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ChgaP26339 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ChgaP26339 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ChgaP26339 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ChgaP26339 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ChgaP26339 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ChgaP26339 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ChgaP26339 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
ChgaP26339 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ChgaP26339 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ChgaP26339 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ChgaP26339 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ChgaP26339 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ChgaP26339 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ChgaP26339 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ChgaP26339 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ChgaP26339 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ChgaP26339 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ChgaP26339 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ChgaP26339 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ChgaP26339 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ChgaP26339 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ChgaP26339 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ChgaP26339 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ChgaP26339 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ChgaP26339 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ChgaP26339 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ChgaP26339 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ChgaP26339 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ChgaP26339 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ChgaP26339 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ChgaP26339 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ChgaP26339 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ChgaP26339 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ChgaP26339 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ChgaP26339 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ChgaP26339 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ChgaP26339 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ChgaP26339 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ChgaP26339 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ChgaP26339 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ChgaP26339 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ChgaP26339 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.76
ChgaP26339 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ChgaP26339 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ChgaP26339 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ChgaP26339 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
ChgaP26339 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
ChgaP26339 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ChgaP26339 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ChgaP26339 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ChgaP26339 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ChgaP26339 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ChgaP26339 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ChgaP26339 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ChgaP26339 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ChgaP26339 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ChgaP26339 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ChgaP26339 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
ChgaP26339 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
ChgaP26339 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ChgaP26339 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ChgaP26339 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ChgaP26339 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ChgaP26339 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ChgaP26339 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ChgaP26339 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ChgaP26339 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ChgaP26339 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ChgaP26339 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ChgaP26339 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ChgaP26339 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ChgaP26339 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ChgaP26339 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ChgaP26339 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ChgaP26339 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms