Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NdnP25233 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NdnP25233 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NdnP25233 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NdnP25233 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NdnP25233 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NdnP25233 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NdnP25233 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NdnP25233 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NdnP25233 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NdnP25233 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NdnP25233 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NdnP25233 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NdnP25233 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NdnP25233 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NdnP25233 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NdnP25233 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NdnP25233 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NdnP25233 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NdnP25233 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NdnP25233 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NdnP25233 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NdnP25233 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NdnP25233 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NdnP25233 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NdnP25233 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NdnP25233 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NdnP25233 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NdnP25233 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NdnP25233 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NdnP25233 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NdnP25233 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NdnP25233 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NdnP25233 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NdnP25233 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NdnP25233 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NdnP25233 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NdnP25233 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NdnP25233 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NdnP25233 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NdnP25233 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NdnP25233 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NdnP25233 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NdnP25233 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NdnP25233 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NdnP25233 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NdnP25233 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NdnP25233 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NdnP25233 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NdnP25233 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NdnP25233 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NdnP25233 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NdnP25233 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NdnP25233 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NdnP25233 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NdnP25233 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NdnP25233 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NdnP25233 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NdnP25233 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NdnP25233 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NdnP25233 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NdnP25233 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
NdnP25233 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NdnP25233 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NdnP25233 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NdnP25233 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NdnP25233 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NdnP25233 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NdnP25233 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NdnP25233 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NdnP25233 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NdnP25233 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NdnP25233 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NdnP25233 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NdnP25233 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NdnP25233 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NdnP25233 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NdnP25233 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NdnP25233 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NdnP25233 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NdnP25233 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NdnP25233 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NdnP25233 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NdnP25233 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NdnP25233 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NdnP25233 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NdnP25233 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NdnP25233 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NdnP25233 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NdnP25233 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NdnP25233 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NdnP25233 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NdnP25233 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NdnP25233 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NdnP25233 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NdnP25233 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NdnP25233 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NdnP25233 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NdnP25233 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NdnP25233 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms