Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hoxd11P23813 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hoxd11P23813 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hoxd11P23813 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hoxd11P23813 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hoxd11P23813 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hoxd11P23813 Rnf212-202ENSMUST00000196652 853 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hoxd11P23813 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hoxd11P23813 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hoxd11P23813 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hoxd11P23813 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hoxd11P23813 Gm28925-201ENSMUST00000188586 168 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Hoxd11P23813 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hoxd11P23813 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hoxd11P23813 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hoxd11P23813 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hoxd11P23813 Gm42565-201ENSMUST00000197839 572 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hoxd11P23813 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hoxd11P23813 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hoxd11P23813 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hoxd11P23813 Gm27227-201ENSMUST00000183413 633 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hoxd11P23813 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hoxd11P23813 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hoxd11P23813 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hoxd11P23813 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hoxd11P23813 Krcc1-201ENSMUST00000080949 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hoxd11P23813 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hoxd11P23813 9030204H09Rik-201ENSMUST00000139455 653 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Hoxd11P23813 Gm43066-201ENSMUST00000199589 1260 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Hoxd11P23813 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Hoxd11P23813 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Hoxd11P23813 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hoxd11P23813 AC102542.1-201ENSMUST00000225204 1138 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Hoxd11P23813 Rpp30-201ENSMUST00000025714 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hoxd11P23813 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hoxd11P23813 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hoxd11P23813 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hoxd11P23813 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hoxd11P23813 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hoxd11P23813 Gm45166-201ENSMUST00000209073 683 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Hoxd11P23813 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hoxd11P23813 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hoxd11P23813 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hoxd11P23813 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hoxd11P23813 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Hoxd11P23813 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hoxd11P23813 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hoxd11P23813 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hoxd11P23813 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hoxd11P23813 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hoxd11P23813 Gm42919-201ENSMUST00000197753 1284 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Hoxd11P23813 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Hoxd11P23813 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Hoxd11P23813 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hoxd11P23813 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hoxd11P23813 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hoxd11P23813 Gm5797-201ENSMUST00000100886 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hoxd11P23813 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hoxd11P23813 Gm3149-201ENSMUST00000112779 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hoxd11P23813 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hoxd11P23813 Gm8362-202ENSMUST00000170673 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hoxd11P23813 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hoxd11P23813 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Hoxd11P23813 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hoxd11P23813 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hoxd11P23813 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hoxd11P23813 Il2-201ENSMUST00000029275 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hoxd11P23813 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hoxd11P23813 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hoxd11P23813 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hoxd11P23813 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hoxd11P23813 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hoxd11P23813 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Hoxd11P23813 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Hoxd11P23813 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hoxd11P23813 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hoxd11P23813 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hoxd11P23813 CT025561.1-201ENSMUST00000214972 674 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Hoxd11P23813 AC160962.2-201ENSMUST00000224761 632 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Hoxd11P23813 Olfr1437-201ENSMUST00000052558 1177 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hoxd11P23813 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Hoxd11P23813 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hoxd11P23813 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hoxd11P23813 Bud31-203ENSMUST00000160075 928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hoxd11P23813 Gm20618-202ENSMUST00000177482 1227 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hoxd11P23813 AC154517.1-201ENSMUST00000222785 629 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hoxd11P23813 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hoxd11P23813 1700120G11Rik-201ENSMUST00000150273 491 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hoxd11P23813 Adam3-210ENSMUST00000171611 1202 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hoxd11P23813 AC154849.3-201ENSMUST00000223733 1660 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Hoxd11P23813 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hoxd11P23813 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hoxd11P23813 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hoxd11P23813 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hoxd11P23813 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hoxd11P23813 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hoxd11P23813 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hoxd11P23813 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hoxd11P23813 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hoxd11P23813 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms