Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Eif3aP23116 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Eif3aP23116 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Eif3aP23116 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Eif3aP23116 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Eif3aP23116 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Eif3aP23116 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Eif3aP23116 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Eif3aP23116 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Eif3aP23116 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Eif3aP23116 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Eif3aP23116 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Eif3aP23116 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Eif3aP23116 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Eif3aP23116 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Eif3aP23116 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Eif3aP23116 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Eif3aP23116 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Eif3aP23116 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Eif3aP23116 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Eif3aP23116 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Eif3aP23116 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Eif3aP23116 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Eif3aP23116 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Eif3aP23116 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Eif3aP23116 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Eif3aP23116 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Eif3aP23116 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Eif3aP23116 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Eif3aP23116 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Eif3aP23116 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Eif3aP23116 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Eif3aP23116 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Eif3aP23116 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Eif3aP23116 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Eif3aP23116 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Eif3aP23116 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Eif3aP23116 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Eif3aP23116 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Eif3aP23116 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Eif3aP23116 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Eif3aP23116 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Eif3aP23116 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Eif3aP23116 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Eif3aP23116 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Eif3aP23116 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Eif3aP23116 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Eif3aP23116 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Eif3aP23116 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Eif3aP23116 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Eif3aP23116 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Eif3aP23116 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Eif3aP23116 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Eif3aP23116 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Eif3aP23116 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Eif3aP23116 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Eif3aP23116 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Eif3aP23116 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Eif3aP23116 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Eif3aP23116 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Eif3aP23116 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Eif3aP23116 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Eif3aP23116 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Eif3aP23116 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Eif3aP23116 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Eif3aP23116 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Eif3aP23116 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Eif3aP23116 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Eif3aP23116 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Eif3aP23116 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Eif3aP23116 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Eif3aP23116 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Eif3aP23116 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Eif3aP23116 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Eif3aP23116 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Eif3aP23116 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Eif3aP23116 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Eif3aP23116 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Eif3aP23116 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Eif3aP23116 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Eif3aP23116 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Eif3aP23116 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Eif3aP23116 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Eif3aP23116 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Eif3aP23116 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Eif3aP23116 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Eif3aP23116 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Eif3aP23116 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Eif3aP23116 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Eif3aP23116 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Eif3aP23116 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Eif3aP23116 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Eif3aP23116 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Eif3aP23116 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Eif3aP23116 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Eif3aP23116 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Eif3aP23116 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Eif3aP23116 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Eif3aP23116 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Eif3aP23116 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.4 ms