Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RarbP22605 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RarbP22605 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RarbP22605 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RarbP22605 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RarbP22605 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RarbP22605 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RarbP22605 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RarbP22605 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RarbP22605 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RarbP22605 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RarbP22605 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RarbP22605 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RarbP22605 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RarbP22605 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RarbP22605 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RarbP22605 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RarbP22605 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RarbP22605 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RarbP22605 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RarbP22605 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RarbP22605 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RarbP22605 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RarbP22605 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RarbP22605 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RarbP22605 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RarbP22605 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RarbP22605 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RarbP22605 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RarbP22605 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RarbP22605 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RarbP22605 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RarbP22605 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RarbP22605 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RarbP22605 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RarbP22605 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RarbP22605 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RarbP22605 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RarbP22605 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RarbP22605 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RarbP22605 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RarbP22605 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RarbP22605 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RarbP22605 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RarbP22605 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RarbP22605 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RarbP22605 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RarbP22605 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RarbP22605 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RarbP22605 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RarbP22605 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RarbP22605 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RarbP22605 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RarbP22605 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RarbP22605 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RarbP22605 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RarbP22605 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RarbP22605 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RarbP22605 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RarbP22605 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RarbP22605 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RarbP22605 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RarbP22605 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RarbP22605 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RarbP22605 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RarbP22605 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RarbP22605 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RarbP22605 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RarbP22605 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RarbP22605 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RarbP22605 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RarbP22605 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RarbP22605 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RarbP22605 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RarbP22605 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RarbP22605 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RarbP22605 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RarbP22605 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RarbP22605 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RarbP22605 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RarbP22605 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RarbP22605 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RarbP22605 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RarbP22605 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RarbP22605 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RarbP22605 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RarbP22605 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RarbP22605 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RarbP22605 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RarbP22605 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RarbP22605 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RarbP22605 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RarbP22605 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RarbP22605 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RarbP22605 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RarbP22605 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RarbP22605 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RarbP22605 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RarbP22605 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RarbP22605 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 145.1 ms