Protein–RNA interactions for Protein: P22339

Gadd45b, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 beta, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gadd45bP22339 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gadd45bP22339 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gadd45bP22339 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gadd45bP22339 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gadd45bP22339 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Gadd45bP22339 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gadd45bP22339 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gadd45bP22339 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gadd45bP22339 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gadd45bP22339 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gadd45bP22339 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gadd45bP22339 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gadd45bP22339 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gadd45bP22339 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gadd45bP22339 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gadd45bP22339 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gadd45bP22339 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gadd45bP22339 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gadd45bP22339 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gadd45bP22339 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gadd45bP22339 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Gadd45bP22339 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gadd45bP22339 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gadd45bP22339 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gadd45bP22339 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gadd45bP22339 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gadd45bP22339 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gadd45bP22339 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gadd45bP22339 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gadd45bP22339 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gadd45bP22339 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gadd45bP22339 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gadd45bP22339 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gadd45bP22339 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gadd45bP22339 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gadd45bP22339 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gadd45bP22339 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gadd45bP22339 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gadd45bP22339 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gadd45bP22339 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gadd45bP22339 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gadd45bP22339 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gadd45bP22339 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gadd45bP22339 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gadd45bP22339 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gadd45bP22339 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Gadd45bP22339 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gadd45bP22339 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gadd45bP22339 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Gadd45bP22339 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Gadd45bP22339 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Gadd45bP22339 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gadd45bP22339 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gadd45bP22339 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gadd45bP22339 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gadd45bP22339 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gadd45bP22339 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gadd45bP22339 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gadd45bP22339 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Gadd45bP22339 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gadd45bP22339 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gadd45bP22339 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gadd45bP22339 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gadd45bP22339 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gadd45bP22339 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gadd45bP22339 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gadd45bP22339 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gadd45bP22339 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gadd45bP22339 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gadd45bP22339 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gadd45bP22339 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gadd45bP22339 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gadd45bP22339 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gadd45bP22339 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gadd45bP22339 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gadd45bP22339 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gadd45bP22339 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gadd45bP22339 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gadd45bP22339 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gadd45bP22339 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gadd45bP22339 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gadd45bP22339 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gadd45bP22339 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gadd45bP22339 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gadd45bP22339 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gadd45bP22339 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gadd45bP22339 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gadd45bP22339 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gadd45bP22339 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gadd45bP22339 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gadd45bP22339 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gadd45bP22339 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gadd45bP22339 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gadd45bP22339 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gadd45bP22339 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gadd45bP22339 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gadd45bP22339 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gadd45bP22339 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gadd45bP22339 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Gadd45bP22339 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms