Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
P20040 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
P20040 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
P20040 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
P20040 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
P20040 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
P20040 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
P20040 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
P20040 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
P20040 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
P20040 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
P20040 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
P20040 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
P20040 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
P20040 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
P20040 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
P20040 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
P20040 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
P20040 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
P20040 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
P20040 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
P20040 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
P20040 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
P20040 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
P20040 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
P20040 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
P20040 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
P20040 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
P20040 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
P20040 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
P20040 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
P20040 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
P20040 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
P20040 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
P20040 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
P20040 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
P20040 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
P20040 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
P20040 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
P20040 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
P20040 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
P20040 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
P20040 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
P20040 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
P20040 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
P20040 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
P20040 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
P20040 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
P20040 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
P20040 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
P20040 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
P20040 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
P20040 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
P20040 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
P20040 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
P20040 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
P20040 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
P20040 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
P20040 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
P20040 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
P20040 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
P20040 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
P20040 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
P20040 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
P20040 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
P20040 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
P20040 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
P20040 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
P20040 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
P20040 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
P20040 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
P20040 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
P20040 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
P20040 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
P20040 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
P20040 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
P20040 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
P20040 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
P20040 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
P20040 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
P20040 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
P20040 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
P20040 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
P20040 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
P20040 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
P20040 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
P20040 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
P20040 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
P20040 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
P20040 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
P20040 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
P20040 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
P20040 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
P20040 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
P20040 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
P20040 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
P20040 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
P20040 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
P20040 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
P20040 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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