Protein–RNA interactions for Protein: P19437

Ms4a1, B-lymphocyte antigen CD20, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a1P19437 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ms4a1P19437 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ms4a1P19437 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ms4a1P19437 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ms4a1P19437 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ms4a1P19437 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ms4a1P19437 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ms4a1P19437 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ms4a1P19437 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ms4a1P19437 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ms4a1P19437 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ms4a1P19437 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ms4a1P19437 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ms4a1P19437 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ms4a1P19437 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ms4a1P19437 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ms4a1P19437 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ms4a1P19437 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ms4a1P19437 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ms4a1P19437 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ms4a1P19437 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ms4a1P19437 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ms4a1P19437 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ms4a1P19437 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ms4a1P19437 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ms4a1P19437 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ms4a1P19437 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ms4a1P19437 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ms4a1P19437 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ms4a1P19437 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ms4a1P19437 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ms4a1P19437 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ms4a1P19437 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ms4a1P19437 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ms4a1P19437 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ms4a1P19437 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ms4a1P19437 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ms4a1P19437 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ms4a1P19437 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ms4a1P19437 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ms4a1P19437 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ms4a1P19437 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ms4a1P19437 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ms4a1P19437 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ms4a1P19437 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ms4a1P19437 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ms4a1P19437 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ms4a1P19437 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ms4a1P19437 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ms4a1P19437 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ms4a1P19437 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ms4a1P19437 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ms4a1P19437 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ms4a1P19437 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ms4a1P19437 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ms4a1P19437 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ms4a1P19437 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ms4a1P19437 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ms4a1P19437 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ms4a1P19437 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ms4a1P19437 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ms4a1P19437 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ms4a1P19437 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ms4a1P19437 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ms4a1P19437 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ms4a1P19437 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ms4a1P19437 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ms4a1P19437 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ms4a1P19437 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ms4a1P19437 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ms4a1P19437 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ms4a1P19437 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ms4a1P19437 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ms4a1P19437 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ms4a1P19437 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ms4a1P19437 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ms4a1P19437 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ms4a1P19437 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ms4a1P19437 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ms4a1P19437 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ms4a1P19437 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ms4a1P19437 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ms4a1P19437 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ms4a1P19437 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ms4a1P19437 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ms4a1P19437 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ms4a1P19437 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ms4a1P19437 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ms4a1P19437 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ms4a1P19437 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ms4a1P19437 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ms4a1P19437 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ms4a1P19437 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ms4a1P19437 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ms4a1P19437 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ms4a1P19437 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ms4a1P19437 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ms4a1P19437 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ms4a1P19437 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ms4a1P19437 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms