Protein–RNA interactions for Protein: P19001

Krt19, Keratin, type I cytoskeletal 19, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt19P19001 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt19P19001 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt19P19001 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt19P19001 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Krt19P19001 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt19P19001 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt19P19001 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt19P19001 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt19P19001 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt19P19001 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt19P19001 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt19P19001 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt19P19001 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt19P19001 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt19P19001 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt19P19001 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt19P19001 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt19P19001 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt19P19001 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt19P19001 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt19P19001 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt19P19001 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt19P19001 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt19P19001 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt19P19001 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt19P19001 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt19P19001 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt19P19001 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt19P19001 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt19P19001 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt19P19001 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt19P19001 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt19P19001 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt19P19001 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt19P19001 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt19P19001 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt19P19001 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt19P19001 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt19P19001 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt19P19001 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt19P19001 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt19P19001 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt19P19001 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Krt19P19001 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt19P19001 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt19P19001 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt19P19001 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt19P19001 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt19P19001 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt19P19001 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt19P19001 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt19P19001 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt19P19001 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt19P19001 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt19P19001 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt19P19001 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt19P19001 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt19P19001 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt19P19001 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt19P19001 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt19P19001 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt19P19001 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt19P19001 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt19P19001 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt19P19001 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt19P19001 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt19P19001 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt19P19001 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt19P19001 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt19P19001 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt19P19001 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt19P19001 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt19P19001 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt19P19001 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt19P19001 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt19P19001 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt19P19001 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt19P19001 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt19P19001 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt19P19001 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt19P19001 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt19P19001 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt19P19001 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt19P19001 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt19P19001 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt19P19001 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt19P19001 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt19P19001 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Krt19P19001 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Krt19P19001 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Krt19P19001 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Krt19P19001 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Krt19P19001 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt19P19001 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt19P19001 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt19P19001 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt19P19001 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt19P19001 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt19P19001 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt19P19001 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms