Protein–RNA interactions for Protein: P18828

Sdc1, Syndecan-1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc1P18828 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sdc1P18828 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sdc1P18828 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sdc1P18828 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sdc1P18828 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sdc1P18828 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sdc1P18828 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sdc1P18828 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sdc1P18828 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sdc1P18828 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sdc1P18828 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sdc1P18828 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sdc1P18828 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sdc1P18828 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sdc1P18828 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sdc1P18828 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sdc1P18828 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sdc1P18828 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sdc1P18828 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sdc1P18828 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sdc1P18828 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sdc1P18828 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sdc1P18828 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sdc1P18828 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sdc1P18828 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sdc1P18828 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sdc1P18828 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sdc1P18828 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sdc1P18828 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sdc1P18828 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sdc1P18828 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sdc1P18828 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sdc1P18828 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sdc1P18828 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sdc1P18828 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sdc1P18828 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sdc1P18828 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sdc1P18828 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sdc1P18828 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sdc1P18828 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sdc1P18828 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sdc1P18828 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sdc1P18828 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sdc1P18828 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sdc1P18828 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sdc1P18828 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sdc1P18828 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sdc1P18828 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sdc1P18828 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sdc1P18828 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Sdc1P18828 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sdc1P18828 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sdc1P18828 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sdc1P18828 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sdc1P18828 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sdc1P18828 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Sdc1P18828 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sdc1P18828 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sdc1P18828 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sdc1P18828 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sdc1P18828 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sdc1P18828 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Sdc1P18828 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sdc1P18828 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sdc1P18828 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sdc1P18828 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sdc1P18828 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sdc1P18828 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sdc1P18828 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sdc1P18828 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sdc1P18828 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sdc1P18828 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sdc1P18828 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sdc1P18828 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sdc1P18828 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sdc1P18828 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sdc1P18828 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sdc1P18828 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sdc1P18828 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sdc1P18828 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sdc1P18828 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Sdc1P18828 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sdc1P18828 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sdc1P18828 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sdc1P18828 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sdc1P18828 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Sdc1P18828 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sdc1P18828 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sdc1P18828 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sdc1P18828 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sdc1P18828 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sdc1P18828 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sdc1P18828 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sdc1P18828 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sdc1P18828 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sdc1P18828 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sdc1P18828 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sdc1P18828 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sdc1P18828 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sdc1P18828 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms