Protein–RNA interactions for Protein: P17125

Tgfb3, Transforming growth factor beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb3P17125 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tgfb3P17125 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tgfb3P17125 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tgfb3P17125 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tgfb3P17125 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tgfb3P17125 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tgfb3P17125 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tgfb3P17125 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tgfb3P17125 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Tgfb3P17125 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tgfb3P17125 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tgfb3P17125 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tgfb3P17125 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tgfb3P17125 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tgfb3P17125 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tgfb3P17125 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tgfb3P17125 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tgfb3P17125 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tgfb3P17125 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tgfb3P17125 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tgfb3P17125 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tgfb3P17125 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tgfb3P17125 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tgfb3P17125 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tgfb3P17125 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tgfb3P17125 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tgfb3P17125 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tgfb3P17125 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tgfb3P17125 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tgfb3P17125 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tgfb3P17125 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tgfb3P17125 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tgfb3P17125 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tgfb3P17125 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tgfb3P17125 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tgfb3P17125 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tgfb3P17125 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tgfb3P17125 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tgfb3P17125 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tgfb3P17125 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tgfb3P17125 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Tgfb3P17125 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tgfb3P17125 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tgfb3P17125 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tgfb3P17125 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tgfb3P17125 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Tgfb3P17125 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tgfb3P17125 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tgfb3P17125 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tgfb3P17125 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tgfb3P17125 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tgfb3P17125 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tgfb3P17125 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tgfb3P17125 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tgfb3P17125 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tgfb3P17125 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tgfb3P17125 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tgfb3P17125 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tgfb3P17125 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tgfb3P17125 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tgfb3P17125 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Tgfb3P17125 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tgfb3P17125 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tgfb3P17125 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tgfb3P17125 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tgfb3P17125 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tgfb3P17125 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tgfb3P17125 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tgfb3P17125 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tgfb3P17125 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tgfb3P17125 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tgfb3P17125 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tgfb3P17125 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tgfb3P17125 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tgfb3P17125 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tgfb3P17125 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tgfb3P17125 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tgfb3P17125 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tgfb3P17125 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tgfb3P17125 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tgfb3P17125 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tgfb3P17125 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tgfb3P17125 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tgfb3P17125 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tgfb3P17125 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tgfb3P17125 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tgfb3P17125 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tgfb3P17125 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tgfb3P17125 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tgfb3P17125 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Tgfb3P17125 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tgfb3P17125 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tgfb3P17125 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tgfb3P17125 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tgfb3P17125 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Tgfb3P17125 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tgfb3P17125 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tgfb3P17125 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tgfb3P17125 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tgfb3P17125 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms