Protein–RNA interactions for Protein: P14869

Rplp0, 60S acidic ribosomal protein P0, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rplp0P14869 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rplp0P14869 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rplp0P14869 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rplp0P14869 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Rplp0P14869 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Rplp0P14869 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rplp0P14869 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rplp0P14869 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rplp0P14869 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rplp0P14869 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rplp0P14869 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rplp0P14869 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rplp0P14869 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rplp0P14869 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rplp0P14869 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rplp0P14869 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rplp0P14869 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rplp0P14869 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Rplp0P14869 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rplp0P14869 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rplp0P14869 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rplp0P14869 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rplp0P14869 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rplp0P14869 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rplp0P14869 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rplp0P14869 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rplp0P14869 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rplp0P14869 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rplp0P14869 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rplp0P14869 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rplp0P14869 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rplp0P14869 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rplp0P14869 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rplp0P14869 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rplp0P14869 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rplp0P14869 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rplp0P14869 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rplp0P14869 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rplp0P14869 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rplp0P14869 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rplp0P14869 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rplp0P14869 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rplp0P14869 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rplp0P14869 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Rplp0P14869 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rplp0P14869 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rplp0P14869 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rplp0P14869 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rplp0P14869 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rplp0P14869 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Rplp0P14869 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rplp0P14869 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rplp0P14869 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rplp0P14869 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rplp0P14869 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rplp0P14869 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rplp0P14869 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rplp0P14869 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rplp0P14869 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rplp0P14869 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rplp0P14869 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rplp0P14869 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rplp0P14869 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rplp0P14869 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rplp0P14869 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rplp0P14869 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rplp0P14869 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rplp0P14869 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rplp0P14869 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rplp0P14869 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rplp0P14869 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rplp0P14869 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rplp0P14869 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rplp0P14869 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rplp0P14869 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rplp0P14869 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rplp0P14869 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rplp0P14869 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rplp0P14869 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rplp0P14869 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rplp0P14869 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rplp0P14869 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rplp0P14869 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rplp0P14869 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rplp0P14869 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rplp0P14869 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rplp0P14869 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rplp0P14869 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rplp0P14869 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rplp0P14869 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rplp0P14869 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rplp0P14869 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rplp0P14869 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rplp0P14869 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rplp0P14869 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rplp0P14869 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rplp0P14869 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rplp0P14869 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rplp0P14869 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rplp0P14869 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms