Protein–RNA interactions for Protein: P14733

Lmnb1, Lamin-B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb1P14733 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lmnb1P14733 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Lmnb1P14733 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Lmnb1P14733 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Lmnb1P14733 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Lmnb1P14733 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lmnb1P14733 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lmnb1P14733 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lmnb1P14733 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lmnb1P14733 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lmnb1P14733 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lmnb1P14733 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lmnb1P14733 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lmnb1P14733 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lmnb1P14733 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lmnb1P14733 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Lmnb1P14733 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lmnb1P14733 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lmnb1P14733 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lmnb1P14733 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lmnb1P14733 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lmnb1P14733 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lmnb1P14733 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lmnb1P14733 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lmnb1P14733 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lmnb1P14733 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lmnb1P14733 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lmnb1P14733 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Lmnb1P14733 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Lmnb1P14733 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Lmnb1P14733 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Lmnb1P14733 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Lmnb1P14733 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Lmnb1P14733 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Lmnb1P14733 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lmnb1P14733 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lmnb1P14733 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lmnb1P14733 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lmnb1P14733 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lmnb1P14733 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lmnb1P14733 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lmnb1P14733 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lmnb1P14733 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lmnb1P14733 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lmnb1P14733 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lmnb1P14733 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lmnb1P14733 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lmnb1P14733 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lmnb1P14733 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lmnb1P14733 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lmnb1P14733 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Lmnb1P14733 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lmnb1P14733 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lmnb1P14733 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lmnb1P14733 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lmnb1P14733 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lmnb1P14733 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lmnb1P14733 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lmnb1P14733 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Lmnb1P14733 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lmnb1P14733 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Lmnb1P14733 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lmnb1P14733 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lmnb1P14733 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lmnb1P14733 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lmnb1P14733 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lmnb1P14733 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lmnb1P14733 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lmnb1P14733 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Lmnb1P14733 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lmnb1P14733 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lmnb1P14733 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lmnb1P14733 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lmnb1P14733 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lmnb1P14733 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lmnb1P14733 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lmnb1P14733 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lmnb1P14733 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lmnb1P14733 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lmnb1P14733 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lmnb1P14733 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lmnb1P14733 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lmnb1P14733 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lmnb1P14733 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lmnb1P14733 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lmnb1P14733 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lmnb1P14733 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lmnb1P14733 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lmnb1P14733 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lmnb1P14733 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lmnb1P14733 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lmnb1P14733 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lmnb1P14733 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lmnb1P14733 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lmnb1P14733 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lmnb1P14733 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lmnb1P14733 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lmnb1P14733 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lmnb1P14733 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Lmnb1P14733 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123 ms