Protein–RNA interactions for Protein: P12850

Cxcl1, Growth-regulated alpha protein, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl1P12850 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Cxcl1P12850 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cxcl1P12850 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Cxcl1P12850 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cxcl1P12850 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cxcl1P12850 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cxcl1P12850 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cxcl1P12850 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cxcl1P12850 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cxcl1P12850 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cxcl1P12850 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cxcl1P12850 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cxcl1P12850 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cxcl1P12850 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cxcl1P12850 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cxcl1P12850 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Cxcl1P12850 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cxcl1P12850 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cxcl1P12850 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cxcl1P12850 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cxcl1P12850 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cxcl1P12850 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cxcl1P12850 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cxcl1P12850 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cxcl1P12850 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cxcl1P12850 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cxcl1P12850 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cxcl1P12850 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cxcl1P12850 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cxcl1P12850 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cxcl1P12850 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cxcl1P12850 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cxcl1P12850 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cxcl1P12850 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cxcl1P12850 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cxcl1P12850 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cxcl1P12850 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cxcl1P12850 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cxcl1P12850 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cxcl1P12850 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cxcl1P12850 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cxcl1P12850 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cxcl1P12850 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cxcl1P12850 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cxcl1P12850 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cxcl1P12850 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cxcl1P12850 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cxcl1P12850 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cxcl1P12850 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cxcl1P12850 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cxcl1P12850 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cxcl1P12850 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cxcl1P12850 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cxcl1P12850 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cxcl1P12850 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cxcl1P12850 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cxcl1P12850 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cxcl1P12850 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cxcl1P12850 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cxcl1P12850 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cxcl1P12850 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Cxcl1P12850 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cxcl1P12850 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cxcl1P12850 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cxcl1P12850 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cxcl1P12850 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cxcl1P12850 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cxcl1P12850 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cxcl1P12850 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cxcl1P12850 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cxcl1P12850 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cxcl1P12850 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cxcl1P12850 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cxcl1P12850 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cxcl1P12850 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cxcl1P12850 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cxcl1P12850 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cxcl1P12850 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cxcl1P12850 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cxcl1P12850 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cxcl1P12850 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cxcl1P12850 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cxcl1P12850 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cxcl1P12850 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cxcl1P12850 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cxcl1P12850 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cxcl1P12850 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cxcl1P12850 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cxcl1P12850 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cxcl1P12850 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cxcl1P12850 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cxcl1P12850 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cxcl1P12850 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cxcl1P12850 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cxcl1P12850 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Cxcl1P12850 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cxcl1P12850 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cxcl1P12850 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cxcl1P12850 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cxcl1P12850 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms