Protein–RNA interactions for Protein: P11438

Lamp1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp1P11438 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lamp1P11438 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lamp1P11438 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lamp1P11438 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lamp1P11438 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lamp1P11438 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lamp1P11438 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lamp1P11438 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lamp1P11438 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lamp1P11438 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lamp1P11438 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lamp1P11438 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lamp1P11438 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lamp1P11438 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lamp1P11438 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lamp1P11438 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lamp1P11438 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lamp1P11438 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lamp1P11438 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lamp1P11438 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lamp1P11438 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lamp1P11438 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Lamp1P11438 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lamp1P11438 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lamp1P11438 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lamp1P11438 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lamp1P11438 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lamp1P11438 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lamp1P11438 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lamp1P11438 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lamp1P11438 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lamp1P11438 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lamp1P11438 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Lamp1P11438 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lamp1P11438 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lamp1P11438 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lamp1P11438 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lamp1P11438 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lamp1P11438 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lamp1P11438 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lamp1P11438 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lamp1P11438 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lamp1P11438 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lamp1P11438 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lamp1P11438 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lamp1P11438 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Lamp1P11438 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lamp1P11438 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lamp1P11438 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lamp1P11438 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lamp1P11438 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lamp1P11438 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lamp1P11438 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lamp1P11438 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lamp1P11438 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Lamp1P11438 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lamp1P11438 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lamp1P11438 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lamp1P11438 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lamp1P11438 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lamp1P11438 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lamp1P11438 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lamp1P11438 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lamp1P11438 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lamp1P11438 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lamp1P11438 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lamp1P11438 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lamp1P11438 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lamp1P11438 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lamp1P11438 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lamp1P11438 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lamp1P11438 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lamp1P11438 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lamp1P11438 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lamp1P11438 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lamp1P11438 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lamp1P11438 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lamp1P11438 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lamp1P11438 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lamp1P11438 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lamp1P11438 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lamp1P11438 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lamp1P11438 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Lamp1P11438 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lamp1P11438 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lamp1P11438 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lamp1P11438 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lamp1P11438 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lamp1P11438 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lamp1P11438 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lamp1P11438 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lamp1P11438 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lamp1P11438 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lamp1P11438 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lamp1P11438 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Lamp1P11438 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Lamp1P11438 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lamp1P11438 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lamp1P11438 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lamp1P11438 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms