Protein–RNA interactions for Protein: P11031

Sub1, Activated RNA polymerase II transcriptional coactivator p15, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sub1P11031 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sub1P11031 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sub1P11031 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sub1P11031 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sub1P11031 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sub1P11031 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sub1P11031 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sub1P11031 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sub1P11031 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sub1P11031 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sub1P11031 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sub1P11031 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sub1P11031 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sub1P11031 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sub1P11031 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sub1P11031 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sub1P11031 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sub1P11031 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sub1P11031 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sub1P11031 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sub1P11031 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sub1P11031 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sub1P11031 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sub1P11031 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sub1P11031 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sub1P11031 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sub1P11031 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sub1P11031 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sub1P11031 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sub1P11031 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sub1P11031 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sub1P11031 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sub1P11031 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sub1P11031 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sub1P11031 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sub1P11031 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sub1P11031 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sub1P11031 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sub1P11031 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sub1P11031 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sub1P11031 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sub1P11031 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sub1P11031 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sub1P11031 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sub1P11031 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sub1P11031 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sub1P11031 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sub1P11031 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sub1P11031 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sub1P11031 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sub1P11031 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sub1P11031 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sub1P11031 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sub1P11031 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sub1P11031 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sub1P11031 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sub1P11031 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sub1P11031 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sub1P11031 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sub1P11031 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sub1P11031 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sub1P11031 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sub1P11031 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sub1P11031 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sub1P11031 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sub1P11031 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sub1P11031 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sub1P11031 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sub1P11031 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sub1P11031 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sub1P11031 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sub1P11031 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sub1P11031 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sub1P11031 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sub1P11031 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sub1P11031 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sub1P11031 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sub1P11031 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sub1P11031 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sub1P11031 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sub1P11031 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sub1P11031 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sub1P11031 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sub1P11031 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sub1P11031 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sub1P11031 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sub1P11031 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sub1P11031 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sub1P11031 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sub1P11031 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sub1P11031 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sub1P11031 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sub1P11031 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sub1P11031 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sub1P11031 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sub1P11031 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sub1P11031 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sub1P11031 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sub1P11031 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sub1P11031 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms